14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1289 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1289  hypothetical protein  100 
 
 		 54 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1188  hypothetical protein  77.36 
 
 		 101 aa  89.4  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.813947  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0218  hypothetical protein  50 
 
 		 55 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.173958 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  44.23 
 
 		 532 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  42.31 
 
 		 525 aa  46.2  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  46.15 
 
 		 535 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0748  proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  46.94 
 
 		 263 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  42.31 
 
 		 535 aa  44.7  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1814  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  44.23 
 
 		 540 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  44.23 
 
 		 533 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3007  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  39.13 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  48 
 
 		 563 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4376  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  36.96 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4438  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  36.96 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0931404 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>