11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1421 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1421  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.263177  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1090  hypothetical protein  66.22 
 
 
158 aa  213  5e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1690  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  60.96 
 
 
208 aa  199  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422709  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1871  proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  59.86 
 
 
216 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0411663  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1581  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  57.34 
 
 
215 aa  192  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.24129 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0855  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  54.61 
 
 
206 aa  187  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000345785  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1486  hypothetical protein  59.18 
 
 
216 aa  184  4e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.963821  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0119  hypothetical protein  58.4 
 
 
206 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2754  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  52.82 
 
 
208 aa  167  4e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0201  proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  52.82 
 
 
208 aa  167  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0216517  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.41 
 
 
158 aa  40  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>