27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1581 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1581  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  100 
 
 		 215 aa  447  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.24129 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1871  proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  70.75 
 
 		 216 aa  320  8e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0411663  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1690  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  71.57 
 
 		 208 aa  318  3.9999999999999996e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422709  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0855  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  70.39 
 
 		 206 aa  312  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000345785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1486  hypothetical protein  68.1 
 
 		 216 aa  290  1e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.963821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2754  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  60.1 
 
 		 208 aa  257  1e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0119  hypothetical protein  56.31 
 
 		 206 aa  251  5.000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0201  proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  53.17 
 
 		 208 aa  244  8e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0216517  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1090  hypothetical protein  67.79 
 
 		 158 aa  226  3e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1421  hypothetical protein  57.34 
 
 		 148 aa  192  4e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.263177  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.78 
 
 		 533 aa  50.1  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.25 
 
 		 508 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.25 
 
 		 508 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.25 
 
 		 508 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  41.67 
 
 		 535 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.62 
 
 		 508 aa  46.2  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.94 
 
 		 568 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.43 
 
 		 535 aa  45.1  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  44.44 
 
 		 563 aa  45.1  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  38.78 
 
 		 525 aa  44.3  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1814  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  44.44 
 
 		 540 aa  44.3  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  44.44 
 
 		 532 aa  42.4  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0604  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  28.41 
 
 		 480 aa  42.4  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  31.51 
 
 		 507 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  30.14 
 
 		 508 aa  42  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.88 
 
 		 508 aa  41.6  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  30.14 
 
 		 508 aa  41.6  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>