39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1486 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1486  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.963821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1871  proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  73.61 
 
 		 216 aa  333  7.999999999999999e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0411663  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1690  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  74.52 
 
 		 208 aa  330  1e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422709  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1581  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  68.1 
 
 		 215 aa  310  7.999999999999999e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.24129 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0855  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  65.85 
 
 		 206 aa  299  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000345785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2754  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  58.94 
 
 		 208 aa  261  6.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0201  proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  56.31 
 
 		 208 aa  244  8e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0216517  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0119  hypothetical protein  56.59 
 
 		 206 aa  242  3e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1090  hypothetical protein  71.61 
 
 		 158 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1421  hypothetical protein  59.59 
 
 		 148 aa  195  5.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.263177  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.33 
 
 		 508 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  42.03 
 
 		 568 aa  58.5  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.33 
 
 		 508 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.68 
 
 		 508 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  50 
 
 		 563 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0604  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.63 
 
 		 480 aa  52.8  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.12 
 
 		 508 aa  51.6  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.17 
 
 		 508 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  40.38 
 
 		 535 aa  48.5  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  24.02 
 
 		 508 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  23.58 
 
 		 508 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3480  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  42 
 
 		 544 aa  47  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  40.38 
 
 		 533 aa  47  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  22.22 
 
 		 525 aa  46.2  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06081  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.21 
 
 		 526 aa  45.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  37.74 
 
 		 507 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  40 
 
 		 535 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  40.38 
 
 		 535 aa  44.3  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1814  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.59 
 
 		 540 aa  43.5  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0746  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.08 
 
 		 524 aa  43.5  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  39.29 
 
 		 532 aa  43.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  39.62 
 
 		 532 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1314  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  38.46 
 
 		 530 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0622  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  38.78 
 
 		 546 aa  42.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1731  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  40.38 
 
 		 540 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.19 
 
 		 517 aa  42  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05461  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.73 
 
 		 531 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.121172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  38.78 
 
 		 530 aa  42  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05701  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  41.3 
 
 		 523 aa  41.6  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>