27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1690 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1690  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  100 
 
 		 208 aa  425  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422709  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1871  proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  79.33 
 
 		 216 aa  350  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0411663  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1581  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  71.57 
 
 		 215 aa  318  3e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.24129 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1486  hypothetical protein  74.52 
 
 		 216 aa  309  1e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.963821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0855  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  68.63 
 
 		 206 aa  307  8e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000345785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2754  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  61.84 
 
 		 208 aa  270  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0201  proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  55.83 
 
 		 208 aa  245  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0216517  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0119  hypothetical protein  54.95 
 
 		 206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1090  hypothetical protein  70.95 
 
 		 158 aa  224  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1421  hypothetical protein  60.96 
 
 		 148 aa  199  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.263177  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  41.82 
 
 		 508 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  40.38 
 
 		 535 aa  47  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  40.74 
 
 		 508 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  37.04 
 
 		 525 aa  45.8  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  40.74 
 
 		 508 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0604  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.87 
 
 		 480 aa  45.4  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  42 
 
 		 563 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1814  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.59 
 
 		 540 aa  44.3  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  38.46 
 
 		 533 aa  43.5  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  38.89 
 
 		 535 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.08 
 
 		 508 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  38.46 
 
 		 535 aa  42.7  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  38.89 
 
 		 508 aa  42.4  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.96 
 
 		 507 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  38 
 
 		 568 aa  42  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16830  hypothetical protein  28.21 
 
 		 164 aa  42  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.547063  normal  0.789104 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.08 
 
 		 508 aa  41.6  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>