72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16830 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_16830  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  342  2e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.547063  normal  0.789104 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  32.12 
 
 		 160 aa  92  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  32.5 
 
 		 230 aa  84.3  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  31.37 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  32.61 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  30.92 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  30.07 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0445  flavodoxin  31.3 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2477  flavodoxin  30.46 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0236789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2190  flavodoxin  30.46 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2507  flavodoxin  30.95 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  32.12 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  33.73 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1199  hypothetical protein  32.74 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.315921 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  32.53 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  33.04 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  31.93 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18190  flavodoxin  33.8 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  0.949186 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  26.43 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2509  hypothetical protein  25.85 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1622  hypothetical protein  33.87 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283408  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1081  flavodoxin  26.97 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.590464  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.81 
 
 		 428 aa  58.5  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0950  hypothetical protein  29.17 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.561046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  25.16 
 
 		 489 aa  57.8  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  32.2 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0656  twin-arginine translocation pathway signal  27.33 
 
 		 188 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  25.95 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  24.7 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  30.97 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0770  hypothetical protein  27.74 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000800357 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0214  putative flavodoxin  27.43 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  25.98 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18440  hypothetical protein  31.25 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0493479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  31.36 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  23.75 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32510  flavodoxin protein  29.82 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752902  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0423  putative flavodoxin  28.83 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  29.41 
 
 		 161 aa  50.8  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  25.3 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0944  hypothetical protein  29.91 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.025785  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  25.2 
 
 		 178 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1956  flavodoxin  32.99 
 
 		 205 aa  47.8  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  29.22 
 
 		 200 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  26.35 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  29.29 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  26.98 
 
 		 191 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  30.77 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  28.57 
 
 		 200 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  28.57 
 
 		 200 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  28 
 
 		 175 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  28.57 
 
 		 200 aa  44.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  28.57 
 
 		 199 aa  44.3  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  26.19 
 
 		 199 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  29.17 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  26.19 
 
 		 199 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5938  putative flavodoxin  25.17 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  28.57 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2187  hypothetical protein  33.04 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.772007  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  27.92 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4564  TrpR binding protein WrbA  28.57 
 
 		 208 aa  42.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  24.4 
 
 		 199 aa  42.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1690  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  28.21 
 
 		 208 aa  42  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422709  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  27.92 
 
 		 200 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1205  flavodoxin family protein  27.66 
 
 		 157 aa  42  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 297 aa  41.6  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.9 
 
 		 158 aa  41.6  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3117  hypothetical protein  45.24 
 
 		 228 aa  41.2  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0369569  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0187  hypothetical protein  24.58 
 
 		 176 aa  41.2  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0330126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  29.7 
 
 		 200 aa  40.4  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  29.7 
 
 		 200 aa  40.4  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4089  flavoprotein WrbA  33.07 
 
 		 199 aa  40.4  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>