51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0950 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0950  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  376  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.561046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1622  hypothetical protein  74.3 
 
 		 180 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283408  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0770  hypothetical protein  64.97 
 
 		 179 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000800357 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  57.89 
 
 		 230 aa  207  5e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18440  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  172  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0493479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1956  flavodoxin  44.13 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  43.6 
 
 		 196 aa  158  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  38.15 
 
 		 185 aa  151  5.9999999999999996e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  40.46 
 
 		 178 aa  141  6e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  41.52 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  40.68 
 
 		 172 aa  139  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2507  flavodoxin  39.23 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1081  flavodoxin  40.46 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.590464  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4542  hypothetical protein  40.35 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  37.65 
 
 		 160 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2113  hypothetical protein  38.37 
 
 		 186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000937907 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  33.33 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2190  flavodoxin  36.61 
 
 		 221 aa  122  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2477  flavodoxin  37.22 
 
 		 221 aa  121  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0236789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32510  flavodoxin protein  37.13 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752902  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2509  hypothetical protein  32.61 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0445  flavodoxin  32.42 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 489 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0423  putative flavodoxin  39.72 
 
 		 153 aa  106  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  34.13 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1199  hypothetical protein  36.3 
 
 		 224 aa  104  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.315921 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  35.15 
 
 		 196 aa  104  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0656  twin-arginine translocation pathway signal  32.34 
 
 		 188 aa  101  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  33.91 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  34.34 
 
 		 159 aa  97.8  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  33.12 
 
 		 221 aa  94  9e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18190  flavodoxin  36.47 
 
 		 157 aa  92  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  0.949186 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0214  putative flavodoxin  30.12 
 
 		 155 aa  89.7  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 428 aa  86.3  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  27.43 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  29.38 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  32.23 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  31.15 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  31.4 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0944  hypothetical protein  26.16 
 
 		 158 aa  60.8  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.025785  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16830  hypothetical protein  29.17 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.547063  normal  0.789104 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  20.27 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  24.49 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  25.29 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2081  hypothetical protein  33.71 
 
 		 128 aa  49.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0160966  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  22.82 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  28.47 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  23.08 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  26.85 
 
 		 161 aa  42.4  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1205  flavodoxin family protein  28.44 
 
 		 157 aa  41.6  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1106  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.78 
 
 		 156 aa  41.6  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.796872  normal  0.0316992 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>