52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0656 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0656  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 188 aa  380  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  57.38 
 
 		 189 aa  204  8e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32510  flavodoxin protein  55.62 
 
 		 197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752902  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  53.72 
 
 		 196 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  43.4 
 
 		 196 aa  156  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  35.59 
 
 		 186 aa  134  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  41.77 
 
 		 230 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  36.47 
 
 		 178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  46.62 
 
 		 172 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  36.48 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  38.82 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  39.61 
 
 		 160 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0770  hypothetical protein  35.37 
 
 		 179 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000800357 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  36.69 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1199  hypothetical protein  34.9 
 
 		 224 aa  112  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.315921 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0214  putative flavodoxin  35.57 
 
 		 155 aa  108  5e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1622  hypothetical protein  31.74 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283408  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1956  flavodoxin  32.12 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0423  putative flavodoxin  36 
 
 		 153 aa  102  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0950  hypothetical protein  32.34 
 
 		 180 aa  101  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.561046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  36.91 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2507  flavodoxin  36.62 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2509  hypothetical protein  26.67 
 
 		 205 aa  99  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18190  flavodoxin  34.56 
 
 		 157 aa  94.7  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  0.949186 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18440  hypothetical protein  29.94 
 
 		 174 aa  92.4  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0493479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  33.33 
 
 		 159 aa  91.3  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2113  hypothetical protein  29.45 
 
 		 186 aa  90.5  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000937907 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1081  flavodoxin  33.92 
 
 		 225 aa  89.7  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.590464  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  33.99 
 
 		 159 aa  89  4e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2190  flavodoxin  34.45 
 
 		 221 aa  88.6  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2477  flavodoxin  34.45 
 
 		 221 aa  88.6  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0236789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4542  hypothetical protein  29.7 
 
 		 205 aa  88.2  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0445  flavodoxin  34.45 
 
 		 169 aa  87.4  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  30.26 
 
 		 489 aa  82.4  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  35.94 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.81 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  22.83 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  33.04 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  26.45 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  25.86 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16830  hypothetical protein  27.33 
 
 		 164 aa  57  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.547063  normal  0.789104 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  25.66 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  25.66 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  25.66 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0944  hypothetical protein  29.91 
 
 		 158 aa  52.8  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.025785  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  27.03 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  26.81 
 
 		 170 aa  48.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  25.34 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1980  hypothetical protein  28.83 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.838314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  24.34 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0712  ArsR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 160 aa  41.6  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2505  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.57 
 
 		 264 aa  41.2  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>