63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1804 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  366  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  49.34 
 
 		 160 aa  176  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  43.64 
 
 		 230 aa  174  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  49.33 
 
 		 186 aa  169  1e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  49.02 
 
 		 160 aa  167  7e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0770  hypothetical protein  43.71 
 
 		 179 aa  154  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000800357 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  44.44 
 
 		 196 aa  154  8e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  38.51 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  43.12 
 
 		 172 aa  151  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0950  hypothetical protein  40.46 
 
 		 180 aa  141  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.561046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1622  hypothetical protein  38.15 
 
 		 180 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283408  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2507  flavodoxin  37.85 
 
 		 228 aa  134  8e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  38.82 
 
 		 196 aa  130  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0656  twin-arginine translocation pathway signal  36.47 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  46.04 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32510  flavodoxin protein  38.82 
 
 		 197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752902  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0214  putative flavodoxin  44.85 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0423  putative flavodoxin  45.59 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0445  flavodoxin  37.13 
 
 		 169 aa  124  9e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  37.75 
 
 		 189 aa  120  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1956  flavodoxin  50.93 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2477  flavodoxin  38.62 
 
 		 221 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0236789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2190  flavodoxin  38.62 
 
 		 221 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18440  hypothetical protein  37.95 
 
 		 174 aa  118  6e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0493479  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  36.08 
 
 		 489 aa  111  6e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1199  hypothetical protein  33.73 
 
 		 224 aa  110  8.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.315921 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18190  flavodoxin  35.03 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  0.949186 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1081  flavodoxin  30.86 
 
 		 225 aa  102  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.590464  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  34.19 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  35.57 
 
 		 221 aa  97.1  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 		 428 aa  92.4  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2509  hypothetical protein  27.5 
 
 		 205 aa  91.7  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  30.38 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2113  hypothetical protein  27.22 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000937907 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4542  hypothetical protein  29.7 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  26.58 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  27.27 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  32.46 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  27.13 
 
 		 161 aa  67.4  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  26.62 
 
 		 164 aa  67  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  24.38 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  27.82 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16830  hypothetical protein  32.12 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.547063  normal  0.789104 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  25 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0944  hypothetical protein  32.11 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.025785  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2633  flavodoxin  29.55 
 
 		 141 aa  57.4  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215143  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0712  ArsR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3384  hypothetical protein  35.34 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732427  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2081  hypothetical protein  45.45 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0160966  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 297 aa  55.1  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1980  hypothetical protein  28.15 
 
 		 218 aa  54.3  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.838314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  26.45 
 
 		 170 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3117  hypothetical protein  33.86 
 
 		 228 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0369569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  28.3 
 
 		 191 aa  52.4  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  26.09 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  23.46 
 
 		 178 aa  52  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  27.27 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2384  hypothetical protein  27.87 
 
 		 161 aa  44.7  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1106  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.34 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.796872  normal  0.0316992 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4096  TrpR binding protein WrbA  33.33 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.832118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  22.73 
 
 		 175 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3607  flavodoxin/nitric oxide synthase  26 
 
 		 156 aa  42  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>