67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0519 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  100 
 
 
159 aa  327  3e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0423  putative flavodoxin  60.54 
 
 
153 aa  201  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0214  putative flavodoxin  58.78 
 
 
155 aa  193  7e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  45.34 
 
 
160 aa  143  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  39.24 
 
 
186 aa  137  4.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  44.3 
 
 
172 aa  133  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  46.04 
 
 
178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  40.91 
 
 
160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  39.07 
 
 
230 aa  123  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0445  flavodoxin  38.75 
 
 
169 aa  123  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0770  hypothetical protein  41.13 
 
 
179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000800357 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  42.95 
 
 
189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  37.42 
 
 
196 aa  110  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  38.93 
 
 
196 aa  106  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  31.65 
 
 
185 aa  105  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18190  flavodoxin  37.58 
 
 
157 aa  103  8e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  0.949186 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32510  flavodoxin protein  38.16 
 
 
197 aa  100  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752902  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0656  twin-arginine translocation pathway signal  36.91 
 
 
188 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0950  hypothetical protein  34.34 
 
 
180 aa  97.8  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.561046  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18440  hypothetical protein  34.94 
 
 
174 aa  95.1  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0493479  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  33.99 
 
 
489 aa  93.2  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1622  hypothetical protein  35.21 
 
 
180 aa  92.8  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283408  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  30.77 
 
 
159 aa  91.7  4e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2507  flavodoxin  37.12 
 
 
228 aa  86.7  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  33.79 
 
 
221 aa  85.1  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  31.61 
 
 
159 aa  84.3  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1956  flavodoxin  33.77 
 
 
205 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2509  hypothetical protein  29.68 
 
 
205 aa  80.9  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2477  flavodoxin  34 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0236789  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2190  flavodoxin  34 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1081  flavodoxin  29.07 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.590464  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1199  hypothetical protein  31.16 
 
 
224 aa  79.7  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.315921 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16830  hypothetical protein  30.92 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.547063  normal  0.789104 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  27.27 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4542  hypothetical protein  33.11 
 
 
205 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.36 
 
 
428 aa  72.4  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  32.09 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  33.54 
 
 
193 aa  67.4  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2113  hypothetical protein  30.28 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000937907 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  27.16 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  37.61 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  30.43 
 
 
164 aa  60.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1980  hypothetical protein  35.19 
 
 
218 aa  60.5  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.838314  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  29.75 
 
 
164 aa  58.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  34.15 
 
 
175 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  30.65 
 
 
173 aa  57.4  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  27.85 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  29.06 
 
 
170 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0712  ArsR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
160 aa  54.3  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
297 aa  53.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4431  hypothetical protein  30.89 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4564  hypothetical protein  30.89 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  27.87 
 
 
191 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  29.63 
 
 
164 aa  52  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
164 aa  52.4  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  26.96 
 
 
178 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0944  hypothetical protein  29.63 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.025785  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2045  flavodoxin  28.18 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000806437  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  29.66 
 
 
175 aa  48.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1284  hypothetical protein  30.53 
 
 
163 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201836  normal  0.37398 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0187  hypothetical protein  27.05 
 
 
176 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0330126 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2633  flavodoxin  28.8 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215143  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0608  TrpR binding protein WrbA  28.72 
 
 
198 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0482  ArsR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
163 aa  42  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280132  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1106  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.77 
 
 
156 aa  41.2  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.796872  normal  0.0316992 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3607  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.7 
 
 
156 aa  40.8  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1795  flavodoxin  33.87 
 
 
90 aa  40.8  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000255293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>