34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1284 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1284  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  334  2.9999999999999997e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201836  normal  0.37398 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0712  ArsR family transcriptional regulator  39.62 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
297 aa  104  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  34.97 
 
 
164 aa  102  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0482  ArsR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280132  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2633  flavodoxin  30.77 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215143  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0903  hypothetical protein  26.27 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000048234 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0351  pyruvate carboxyltransferase  36.46 
 
 
142 aa  58.9  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.63457  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  31.19 
 
 
193 aa  54.7  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2384  hypothetical protein  26.81 
 
 
161 aa  55.1  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  30 
 
 
162 aa  53.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  24.27 
 
 
161 aa  50.8  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  36.78 
 
 
175 aa  50.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  30.85 
 
 
186 aa  50.1  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  28.72 
 
 
173 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  33.33 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  33.73 
 
 
175 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  33 
 
 
170 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  25.84 
 
 
161 aa  48.1  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0214  putative flavodoxin  28.09 
 
 
155 aa  48.1  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  28.71 
 
 
159 aa  47  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  28.74 
 
 
191 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  32.56 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  30.53 
 
 
159 aa  45.1  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1980  hypothetical protein  30.77 
 
 
218 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.838314  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  30.95 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  25.62 
 
 
178 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  42  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2453  hypothetical protein  22.5 
 
 
163 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00273719  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  26.67 
 
 
196 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  22.69 
 
 
163 aa  41.2  0.005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  28.41 
 
 
196 aa  41.2  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3000  hypothetical protein  31.03 
 
 
143 aa  40.8  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000872751  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  27.91 
 
 
160 aa  40.4  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>