56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0391 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  100 
 
 
175 aa  361  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  60.47 
 
 
175 aa  201  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5938  putative flavodoxin  46.06 
 
 
177 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  45.75 
 
 
170 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  38.73 
 
 
191 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  37.42 
 
 
178 aa  120  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2187  hypothetical protein  40.88 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.772007  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1745  hypothetical protein  41.61 
 
 
173 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2453  hypothetical protein  37.42 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00273719  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2094  hypothetical protein  41.13 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175818  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  31.48 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  31.58 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  34.48 
 
 
162 aa  63.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1212  hypothetical protein  29.41 
 
 
179 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189155  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  28.89 
 
 
164 aa  63.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0187  hypothetical protein  25 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0330126 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  28.95 
 
 
163 aa  62.4  0.000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  30.56 
 
 
164 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4564  hypothetical protein  26.42 
 
 
176 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4431  hypothetical protein  26.42 
 
 
176 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1980  hypothetical protein  25 
 
 
218 aa  55.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.838314  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  26.85 
 
 
160 aa  55.8  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  28.81 
 
 
196 aa  55.5  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3000  hypothetical protein  23.85 
 
 
143 aa  54.3  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000872751  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  26.36 
 
 
161 aa  53.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3716  hypothetical protein  31.2 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  27.83 
 
 
193 aa  52.4  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  27.27 
 
 
172 aa  52  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0445  flavodoxin  28.07 
 
 
169 aa  52  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  24.6 
 
 
173 aa  51.6  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  27.66 
 
 
489 aa  50.8  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1284  hypothetical protein  36.78 
 
 
163 aa  50.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201836  normal  0.37398 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  22.83 
 
 
221 aa  49.7  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0423  putative flavodoxin  28.18 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
164 aa  49.3  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  28.81 
 
 
230 aa  48.9  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  23.77 
 
 
161 aa  48.5  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  29.66 
 
 
159 aa  48.1  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  26.62 
 
 
159 aa  48.1  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0712  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
160 aa  47.4  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  27.61 
 
 
186 aa  47.4  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18440  hypothetical protein  27.82 
 
 
174 aa  47  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0493479  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  28.46 
 
 
160 aa  47  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2633  flavodoxin  26.97 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215143  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0351  pyruvate carboxyltransferase  31.52 
 
 
142 aa  45.8  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.63457  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0482  ArsR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
163 aa  44.7  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280132  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0214  putative flavodoxin  25.44 
 
 
155 aa  44.3  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2384  hypothetical protein  36.9 
 
 
161 aa  43.5  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  29.51 
 
 
159 aa  43.1  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3607  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.03 
 
 
156 aa  42.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.03 
 
 
428 aa  42  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1509  hypothetical protein  29.35 
 
 
106 aa  41.6  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0944  hypothetical protein  26.32 
 
 
158 aa  41.6  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.025785  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1199  hypothetical protein  25.98 
 
 
224 aa  41.2  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.315921 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  24.43 
 
 
189 aa  41.2  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18190  flavodoxin  28.35 
 
 
157 aa  40.8  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  0.949186 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>