66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0781 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  480  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0770  hypothetical protein  57.99 
 
 
179 aa  218  5e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000800357 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0950  hypothetical protein  57.89 
 
 
180 aa  207  9e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.561046  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1622  hypothetical protein  56.21 
 
 
180 aa  204  9e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283408  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  51.43 
 
 
196 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  55 
 
 
172 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  49.68 
 
 
160 aa  175  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  43.64 
 
 
178 aa  174  9.999999999999999e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2507  flavodoxin  41.59 
 
 
228 aa  170  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  43.95 
 
 
160 aa  169  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  44.23 
 
 
185 aa  166  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  44.52 
 
 
186 aa  160  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18440  hypothetical protein  47.97 
 
 
174 aa  158  5e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0493479  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1956  flavodoxin  35.68 
 
 
205 aa  155  4e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  43.42 
 
 
489 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1199  hypothetical protein  30.91 
 
 
224 aa  144  9e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.315921 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  42.38 
 
 
196 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32510  flavodoxin protein  41.67 
 
 
197 aa  141  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752902  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  41.61 
 
 
189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  39.11 
 
 
221 aa  137  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0445  flavodoxin  37.35 
 
 
169 aa  135  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2477  flavodoxin  37.43 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0236789  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0656  twin-arginine translocation pathway signal  41.77 
 
 
188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2190  flavodoxin  45.04 
 
 
221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0423  putative flavodoxin  42.28 
 
 
153 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2509  hypothetical protein  35.56 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  37.89 
 
 
159 aa  123  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2113  hypothetical protein  34.59 
 
 
186 aa  123  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000937907 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  39.07 
 
 
159 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4542  hypothetical protein  36.42 
 
 
205 aa  121  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1081  flavodoxin  36.69 
 
 
225 aa  121  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.590464  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0214  putative flavodoxin  39.42 
 
 
155 aa  116  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18190  flavodoxin  35.44 
 
 
157 aa  115  6e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  0.949186 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  34.18 
 
 
159 aa  102  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 
428 aa  100  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  32.85 
 
 
163 aa  93.6  2e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16830  hypothetical protein  32.5 
 
 
164 aa  84.3  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.547063  normal  0.789104 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  31.82 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  31.82 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  31.17 
 
 
164 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  32.2 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  28.48 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  32.54 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  31.21 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0944  hypothetical protein  30.19 
 
 
158 aa  64.3  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.025785  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  28.24 
 
 
161 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  30.67 
 
 
178 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2081  hypothetical protein  28.57 
 
 
128 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0160966  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  30.3 
 
 
164 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1980  hypothetical protein  24.22 
 
 
218 aa  53.5  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.838314  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  25.76 
 
 
191 aa  52  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  26.23 
 
 
175 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  24.59 
 
 
173 aa  50.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  26.39 
 
 
164 aa  50.1  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  28.81 
 
 
175 aa  48.9  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
297 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2633  flavodoxin  30.08 
 
 
141 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215143  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1205  flavodoxin family protein  30.53 
 
 
157 aa  46.6  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5938  putative flavodoxin  25.22 
 
 
177 aa  46.2  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1106  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.53 
 
 
156 aa  45.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.796872  normal  0.0316992 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3607  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.47 
 
 
156 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4564  hypothetical protein  23.81 
 
 
176 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4431  hypothetical protein  23.81 
 
 
176 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3117  hypothetical protein  25.78 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0369569  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1284  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  42  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201836  normal  0.37398 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0260  iron-sulfur cluster-binding protein  22.97 
 
 
303 aa  41.6  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>