58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0423 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0423  putative flavodoxin  100 
 
 
153 aa  313  4e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0214  putative flavodoxin  70.39 
 
 
155 aa  234  4e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  60.54 
 
 
159 aa  201  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  50.37 
 
 
172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  50.39 
 
 
160 aa  137  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  45.59 
 
 
186 aa  134  4e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  42.28 
 
 
230 aa  128  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  45.59 
 
 
178 aa  125  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  42 
 
 
160 aa  120  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0445  flavodoxin  37.27 
 
 
169 aa  118  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  34.44 
 
 
185 aa  110  6e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  36.42 
 
 
196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0950  hypothetical protein  39.72 
 
 
180 aa  106  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.561046  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0656  twin-arginine translocation pathway signal  36 
 
 
188 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1622  hypothetical protein  34.97 
 
 
180 aa  95.9  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283408  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0770  hypothetical protein  37.8 
 
 
179 aa  94.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000800357 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  34.67 
 
 
196 aa  92.8  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  34.23 
 
 
189 aa  91.3  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18440  hypothetical protein  31.95 
 
 
174 aa  89  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0493479  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2507  flavodoxin  39.62 
 
 
228 aa  88.6  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  34.53 
 
 
489 aa  87.4  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18190  flavodoxin  33.77 
 
 
157 aa  87  7e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  0.949186 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32510  flavodoxin protein  33.56 
 
 
197 aa  87  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752902  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  32.26 
 
 
159 aa  84.7  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1199  hypothetical protein  28.67 
 
 
224 aa  80.5  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.315921 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2509  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  31.85 
 
 
221 aa  79  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2190  flavodoxin  29.45 
 
 
221 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2477  flavodoxin  29.45 
 
 
221 aa  72  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0236789  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  28.48 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2113  hypothetical protein  27.27 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000937907 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4542  hypothetical protein  28.87 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1956  flavodoxin  33.94 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  28.78 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1081  flavodoxin  28.87 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.590464  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.94 
 
 
428 aa  64.3  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  29.49 
 
 
193 aa  64.3  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  26.62 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  33.62 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1980  hypothetical protein  30.95 
 
 
218 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.838314  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  26.5 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
297 aa  54.3  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16830  hypothetical protein  28.83 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.547063  normal  0.789104 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0944  hypothetical protein  25.83 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.025785  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0712  ArsR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
160 aa  50.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
164 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  27.19 
 
 
173 aa  48.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  28.18 
 
 
175 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  26.67 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  27.27 
 
 
178 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  27.34 
 
 
164 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  26.09 
 
 
175 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  25.93 
 
 
164 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  29.27 
 
 
170 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  27.63 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  25.89 
 
 
191 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4564  hypothetical protein  28.57 
 
 
176 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4431  hypothetical protein  28.57 
 
 
176 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>