59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_18190 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_18190  flavodoxin  100 
 
 		 157 aa  323  6e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  0.949186 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  53.55 
 
 		 159 aa  179  2e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  47.13 
 
 		 159 aa  167  7e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  40 
 
 		 161 aa  130  6.999999999999999e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  35.44 
 
 		 230 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  35.9 
 
 		 186 aa  114  5e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  34.16 
 
 		 196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  37.59 
 
 		 163 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32510  flavodoxin protein  38.36 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752902  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  36.71 
 
 		 196 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2190  flavodoxin  33.77 
 
 		 221 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2477  flavodoxin  33.77 
 
 		 221 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0236789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1081  flavodoxin  37.5 
 
 		 225 aa  105  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.590464  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0770  hypothetical protein  34.3 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000800357 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  35.03 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18440  hypothetical protein  37.66 
 
 		 174 aa  104  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0493479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  37.58 
 
 		 159 aa  103  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  29.8 
 
 		 185 aa  98.2  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  33.77 
 
 		 489 aa  97.8  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  34.56 
 
 		 160 aa  97.4  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2507  flavodoxin  36.8 
 
 		 228 aa  96.7  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  35.04 
 
 		 221 aa  95.9  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.88 
 
 		 428 aa  95.5  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0656  twin-arginine translocation pathway signal  34.56 
 
 		 188 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  36.36 
 
 		 189 aa  94.7  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1199  hypothetical protein  40 
 
 		 224 aa  92.8  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.315921 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0950  hypothetical protein  36.47 
 
 		 180 aa  92  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.561046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  33.54 
 
 		 160 aa  90.9  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1956  flavodoxin  32.02 
 
 		 205 aa  90.5  9e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  32.05 
 
 		 172 aa  88.6  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0423  putative flavodoxin  33.77 
 
 		 153 aa  87  8e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0445  flavodoxin  27.81 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0214  putative flavodoxin  29.87 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1622  hypothetical protein  29.48 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283408  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1795  flavodoxin  50.79 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000255293  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2509  hypothetical protein  27.67 
 
 		 205 aa  72  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4542  hypothetical protein  30.97 
 
 		 205 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2113  hypothetical protein  29.68 
 
 		 186 aa  67  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000937907 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  31.43 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  30.71 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  27.78 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16830  hypothetical protein  33.8 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.547063  normal  0.789104 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  29.73 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  24.63 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  25.74 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0944  hypothetical protein  29.46 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.025785  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1980  hypothetical protein  32.43 
 
 		 218 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.838314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  32.2 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0712  ArsR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 297 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  27.61 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2453  hypothetical protein  31.01 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00273719  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2633  flavodoxin  24.81 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215143  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  28.36 
 
 		 178 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  22.88 
 
 		 173 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  29.63 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  28.35 
 
 		 175 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.17 
 
 		 158 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>