67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3236 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  100 
 
 
160 aa  326  7e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  55.77 
 
 
160 aa  184  4e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  49.68 
 
 
230 aa  175  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  53.16 
 
 
196 aa  171  5.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  49.02 
 
 
178 aa  167  6e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  53.21 
 
 
172 aa  159  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  43.95 
 
 
186 aa  153  9e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  42.41 
 
 
185 aa  141  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0770  hypothetical protein  40.35 
 
 
179 aa  135  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000800357 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0445  flavodoxin  42.42 
 
 
169 aa  134  8e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  39.87 
 
 
196 aa  131  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0950  hypothetical protein  37.65 
 
 
180 aa  128  4.0000000000000003e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.561046  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  40.91 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1622  hypothetical protein  39.46 
 
 
180 aa  124  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283408  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32510  flavodoxin protein  37.82 
 
 
197 aa  122  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752902  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0214  putative flavodoxin  40.4 
 
 
155 aa  122  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  38.41 
 
 
189 aa  122  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0423  putative flavodoxin  42 
 
 
153 aa  120  6e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0656  twin-arginine translocation pathway signal  39.61 
 
 
188 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18440  hypothetical protein  36.24 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0493479  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2507  flavodoxin  35.86 
 
 
228 aa  110  7.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  35.1 
 
 
489 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2190  flavodoxin  34.01 
 
 
221 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2477  flavodoxin  34.01 
 
 
221 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0236789  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1081  flavodoxin  36.91 
 
 
225 aa  103  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.590464  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1199  hypothetical protein  30.57 
 
 
224 aa  100  8e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.315921 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  32.35 
 
 
221 aa  99.8  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  34.39 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18190  flavodoxin  33.54 
 
 
157 aa  90.9  7e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  0.949186 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1956  flavodoxin  30.41 
 
 
205 aa  90.9  7e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  33.13 
 
 
193 aa  88.6  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4542  hypothetical protein  27.91 
 
 
205 aa  80.9  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2509  hypothetical protein  30.19 
 
 
205 aa  77.4  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  30.67 
 
 
159 aa  77  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  31.1 
 
 
162 aa  77  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  31.85 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2113  hypothetical protein  26.16 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000937907 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  28.75 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0944  hypothetical protein  29.38 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.025785  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  30.37 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  32.74 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  32.14 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.09 
 
 
428 aa  64.3  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  27.34 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16830  hypothetical protein  26.43 
 
 
164 aa  62  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.547063  normal  0.789104 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1980  hypothetical protein  34.62 
 
 
218 aa  60.5  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.838314  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  29.46 
 
 
170 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  25.6 
 
 
191 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  25.64 
 
 
161 aa  57.4  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  35.14 
 
 
164 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  28.95 
 
 
178 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  29.03 
 
 
175 aa  52  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5938  putative flavodoxin  20.5 
 
 
177 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1205  flavodoxin family protein  29.69 
 
 
157 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1106  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.69 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.796872  normal  0.0316992 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  28.46 
 
 
175 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2081  hypothetical protein  36.36 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0160966  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3607  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.77 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2453  hypothetical protein  26.35 
 
 
163 aa  45.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00273719  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.9 
 
 
158 aa  44.7  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0173  putative dialkylrecorsinol condensing enzyme  25.45 
 
 
309 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2633  flavodoxin  25.74 
 
 
141 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215143  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  24.56 
 
 
164 aa  42  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0712  ArsR family transcriptional regulator  26.27 
 
 
160 aa  41.2  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3669  TrpR binding protein WrbA  26.28 
 
 
199 aa  40.8  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.196893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3117  hypothetical protein  46.67 
 
 
228 aa  40.8  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0369569  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1284  hypothetical protein  27.91 
 
 
163 aa  40.4  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201836  normal  0.37398 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>