96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0478 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  100 
 
 
164 aa  331  3e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  94.51 
 
 
164 aa  319  9.999999999999999e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  92.07 
 
 
164 aa  308  2e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  67.28 
 
 
164 aa  202  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  41.03 
 
 
161 aa  121  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  36.54 
 
 
162 aa  103  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  31.82 
 
 
230 aa  81.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  33.73 
 
 
221 aa  80.9  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  29.32 
 
 
173 aa  79  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2477  flavodoxin  31.08 
 
 
221 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0236789  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2190  flavodoxin  31.08 
 
 
221 aa  78.6  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1622  hypothetical protein  36.97 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283408  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  30.57 
 
 
489 aa  77.4  0.00000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  28.3 
 
 
172 aa  73.9  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0770  hypothetical protein  32.19 
 
 
179 aa  73.9  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000800357 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  29.7 
 
 
196 aa  73.9  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18440  hypothetical protein  31.72 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0493479  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  30.47 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1199  hypothetical protein  31.71 
 
 
224 aa  72  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.315921 
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  28.68 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  36.59 
 
 
193 aa  70.5  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2509  hypothetical protein  26.39 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  27.44 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  27.27 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0950  hypothetical protein  32.23 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.561046  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  30.37 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  30.37 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0445  flavodoxin  26.54 
 
 
169 aa  67  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  25.31 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18190  flavodoxin  31.43 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  0.949186 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  30 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16830  hypothetical protein  32.53 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.547063  normal  0.789104 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  28.89 
 
 
175 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5938  putative flavodoxin  26.96 
 
 
177 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  29.03 
 
 
170 aa  62  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1956  flavodoxin  28.77 
 
 
205 aa  61.2  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0944  hypothetical protein  27.78 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.025785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32510  flavodoxin protein  28.93 
 
 
197 aa  58.9  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752902  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0214  putative flavodoxin  28.03 
 
 
155 aa  57.8  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2453  hypothetical protein  26.58 
 
 
163 aa  57.4  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00273719  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  24.18 
 
 
189 aa  57.4  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1081  flavodoxin  25 
 
 
225 aa  57  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.590464  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  27.85 
 
 
159 aa  57  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.45 
 
 
428 aa  56.6  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  29.03 
 
 
159 aa  56.6  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2384  hypothetical protein  31.71 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  28.57 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2507  flavodoxin  27.59 
 
 
228 aa  55.5  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
297 aa  54.3  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0656  twin-arginine translocation pathway signal  25.66 
 
 
188 aa  53.9  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0712  ArsR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
160 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0187  hypothetical protein  24.43 
 
 
176 aa  51.2  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0330126 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4431  hypothetical protein  28.18 
 
 
176 aa  50.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4564  hypothetical protein  28.18 
 
 
176 aa  50.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  25.62 
 
 
178 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0903  hypothetical protein  33.63 
 
 
157 aa  48.9  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000048234 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0482  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 
163 aa  48.5  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280132  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0423  putative flavodoxin  25.93 
 
 
153 aa  48.1  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3000  hypothetical protein  26.32 
 
 
143 aa  47.4  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000872751  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  24.84 
 
 
196 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2113  hypothetical protein  28.46 
 
 
186 aa  47  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000937907 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  24.32 
 
 
161 aa  46.6  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  28.93 
 
 
212 aa  45.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1980  hypothetical protein  26.42 
 
 
218 aa  45.4  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.838314  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1746  Trp repressor-binding protein  29.7 
 
 
186 aa  45.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3134  TrpR binding protein WrbA  30.71 
 
 
199 aa  44.7  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03195  hypothetical protein  27.86 
 
 
190 aa  44.7  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1212  hypothetical protein  27.59 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189155  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1683  flavoprotein WrbA  25.15 
 
 
207 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.308348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2187  hypothetical protein  30.21 
 
 
173 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.772007  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4564  TrpR binding protein WrbA  25.21 
 
 
208 aa  42.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4096  TrpR binding protein WrbA  28.72 
 
 
199 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.832118  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  26.19 
 
 
203 aa  42  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01007  TrpR binding protein WrbA  26.61 
 
 
198 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002786  Trp repressor-binding protein  27.14 
 
 
189 aa  42  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  30.58 
 
 
201 aa  42  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1516  TrpR binding protein WrbA  28.8 
 
 
198 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.348571 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2638  flavoprotein WrbA  26.61 
 
 
198 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.836437  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2120  TrpR binding protein WrbA  26.61 
 
 
198 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01014  hypothetical protein  26.61 
 
 
198 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  29.84 
 
 
200 aa  42  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1117  TrpR binding protein WrbA  26.61 
 
 
198 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1122  TrpR binding protein WrbA  26.61 
 
 
198 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98388  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2591  TrpR binding protein WrbA  26.61 
 
 
198 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.172537 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0373  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.46 
 
 
202 aa  41.6  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267004  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1665  flavoprotein WrbA  28.57 
 
 
197 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204501  hitchhiker  0.00540913 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  30.51 
 
 
199 aa  41.6  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  30.51 
 
 
199 aa  41.6  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  29.6 
 
 
200 aa  41.2  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4542  hypothetical protein  30 
 
 
205 aa  41.2  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0274  hypothetical protein  42.59 
 
 
168 aa  41.2  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.367825  normal  0.693938 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2521  Trp repressor-binding protein  28.45 
 
 
205 aa  40.8  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1205  flavodoxin family protein  26.9 
 
 
157 aa  40.8  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  29.37 
 
 
199 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  29.37 
 
 
199 aa  40.4  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>