More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03195 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03195  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  393  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002786  Trp repressor-binding protein  93.05 
 
 		 189 aa  364  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1746  Trp repressor-binding protein  74.46 
 
 		 186 aa  287  5.0000000000000004e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0700  hypothetical protein  59.59 
 
 		 199 aa  229  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0682  hypothetical protein  59.59 
 
 		 199 aa  227  7e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0980  flavodoxin/nitric oxide synthase  53.81 
 
 		 202 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02144  Flavodoxin/nitric oxide synthase  55.9 
 
 		 200 aa  211  4.9999999999999996e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0314978  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0867  flavoprotein WrbA  54.92 
 
 		 202 aa  209  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0748564  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0408  trp repressor binding protein  56.48 
 
 		 197 aa  206  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1823  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.96 
 
 		 199 aa  206  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1766  NAD(P)H:quinone oxidoreductase, type IV  56.48 
 
 		 197 aa  206  1e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2340  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.4 
 
 		 200 aa  206  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200739 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.92 
 
 		 200 aa  202  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.938759  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1665  flavoprotein WrbA  55.96 
 
 		 197 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204501  hitchhiker  0.00540913 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4560  Trp repressor binding protein WrbA  56.25 
 
 		 198 aa  202  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.309608  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1995  flavoprotein WrbA  55.96 
 
 		 197 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0899  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  57.29 
 
 		 199 aa  202  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000786086 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1249  NADPH-dependent FMN reductase:flavodoxin/nitric oxide synthase  53.3 
 
 		 200 aa  201  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51990  Trp repressor binding protein WrbA  56.25 
 
 		 198 aa  201  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4229  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.25 
 
 		 198 aa  201  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234243  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1206  flavoprotein WrbA  54.08 
 
 		 201 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2774  flavoprotein WrbA  54.08 
 
 		 200 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2521  Trp repressor-binding protein  58.25 
 
 		 205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1246  flavoprotein WrbA  53.57 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000168945 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1644  trp repressor binding protein  53.06 
 
 		 201 aa  198  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1353  putative Trp repressor binding protein  53.61 
 
 		 200 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.873787  normal  0.272914 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4073  flavodoxin/nitric oxide synthase  53.06 
 
 		 201 aa  198  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0631  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.69 
 
 		 212 aa  198  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1558  TRP repressor binding protein  54.17 
 
 		 201 aa  197  6e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2779  flavoprotein WrbA  52.79 
 
 		 199 aa  197  6e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3069  flavodoxin-like protein  53.37 
 
 		 198 aa  197  7.999999999999999e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.432129  hitchhiker  0.00072414 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0941  flavodoxin  53.33 
 
 		 202 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2990  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.96 
 
 		 198 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.991698  hitchhiker  0.0079617 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0755  flavodoxin  53.33 
 
 		 202 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383175  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0407  flavodoxin  53.33 
 
 		 202 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1706  NADPH-dependent FMN reductase  53.33 
 
 		 202 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1474  flavodoxin  53.33 
 
 		 202 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1684  NADPH-dependent FMN reductase  53.33 
 
 		 202 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.866798  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1861  flavodoxin  53.61 
 
 		 687 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697937  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1130  flavodoxin/nitric oxide synthase  51.81 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0057993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1336  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.32 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.481655  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2619  flavodoxin  53.57 
 
 		 202 aa  195  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2247  flavoprotein WrbA  52.58 
 
 		 205 aa  194  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0973  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.79 
 
 		 206 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0780306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1433  flavoprotein WrbA  54.79 
 
 		 206 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1455  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.79 
 
 		 206 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1686  trp repressor binding protein  54.17 
 
 		 201 aa  194  9e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2485  flavodoxin/nitric oxide synthase  52.04 
 
 		 198 aa  193  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36830  WrbA-like flavodoxin  55.78 
 
 		 200 aa  192  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.740574  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1860  flavoprotein WrbA  54.05 
 
 		 203 aa  192  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000177757 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0715  flavoprotein WrbA  52.85 
 
 		 197 aa  192  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.358899 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1376  flavoprotein WrbA  55.14 
 
 		 206 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.79766 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3703  flavodoxin/nitric oxide synthase  53.12 
 
 		 201 aa  191  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4600  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.59 
 
 		 206 aa  191  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573755  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1897  flavodoxin/nitric oxide synthase  50.26 
 
 		 209 aa  191  7e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1979  tryptophan repressor binding protein  51.81 
 
 		 197 aa  189  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0737  flavoprotein WrbA  49.74 
 
 		 197 aa  187  7e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.438501  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0705  flavodoxin/nitric oxide synthase  49.75 
 
 		 220 aa  187  7e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1474  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0913  flavodoxin/nitric oxide synthase  51.56 
 
 		 203 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0558  flavoprotein WrbA  48.73 
 
 		 205 aa  184  7e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.731292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04556  tryptophan repressor binding protein  49.48 
 
 		 218 aa  184  8e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.816043  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0439  tryptophan repressor binding protein  51.3 
 
 		 199 aa  181  7e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0384  flavoprotein WrbA  51.3 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1576  flavoprotein WrbA  53.61 
 
 		 202 aa  180  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0549  putative Trp repressor binding protein  50.52 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0537  flavodoxin/nitric oxide synthase  50 
 
 		 205 aa  173  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888496 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0520  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.7 
 
 		 184 aa  167  6e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  41.92 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  40.2 
 
 		 200 aa  151  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  40.2 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  39.7 
 
 		 200 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  39.7 
 
 		 200 aa  147  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  39.7 
 
 		 200 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  41.5 
 
 		 199 aa  147  9e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0896  flavoprotein WrbA  39.09 
 
 		 197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  39.7 
 
 		 200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  40.3 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  39.2 
 
 		 200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0396  flavoprotein WrbA  41.41 
 
 		 212 aa  145  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  38.42 
 
 		 204 aa  144  8.000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  40.59 
 
 		 201 aa  142  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  38.31 
 
 		 200 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0373  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.3 
 
 		 202 aa  142  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267004  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  40.2 
 
 		 200 aa  141  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  36.89 
 
 		 204 aa  140  8e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  38.12 
 
 		 203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  38.89 
 
 		 200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  39.7 
 
 		 199 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  39.7 
 
 		 199 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  38.12 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1683  flavoprotein WrbA  38.16 
 
 		 207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.308348  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  39.8 
 
 		 199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  39.11 
 
 		 204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  38.92 
 
 		 206 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  39 
 
 		 199 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  37.81 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2002  TrpR binding protein WrbA  40.3 
 
 		 199 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  39.64 
 
 		 204 aa  131  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4089  flavoprotein WrbA  37.31 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  39.8 
 
 		 200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>