More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4280 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  100 
 
 		 199 aa  406  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  100 
 
 		 199 aa  406  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  95.98 
 
 		 199 aa  394  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  89.39 
 
 		 200 aa  365  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  82.91 
 
 		 199 aa  345  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  80.9 
 
 		 199 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  73.74 
 
 		 200 aa  303  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4564  TrpR binding protein WrbA  73.37 
 
 		 208 aa  292  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2810  TrpR binding protein WrbA  69.35 
 
 		 199 aa  290  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111031 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  69 
 
 		 212 aa  289  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1594  TrpR binding protein WrbA  69.19 
 
 		 198 aa  286  9e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  67.84 
 
 		 200 aa  284  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0979  TrpR binding protein WrbA  69.85 
 
 		 199 aa  282  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  66.33 
 
 		 200 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  66.83 
 
 		 200 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  66.83 
 
 		 200 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  66.83 
 
 		 200 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1650  TrpR binding protein WrbA  70.35 
 
 		 199 aa  281  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207552  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1049  TrpR binding protein WrbA  70.35 
 
 		 199 aa  281  5.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1014  TrpR binding protein WrbA  70.35 
 
 		 199 aa  281  5.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3216  flavoprotein WrbA  67.84 
 
 		 199 aa  280  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103808 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4352  TrpR binding protein WrbA  70.35 
 
 		 199 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4332  flavoprotein WrbA  68.34 
 
 		 199 aa  279  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2002  TrpR binding protein WrbA  71.86 
 
 		 199 aa  279  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0057  flavoprotein WrbA  68.84 
 
 		 200 aa  279  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  66.5 
 
 		 200 aa  278  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2136  TrpR binding protein WrbA  69.04 
 
 		 199 aa  278  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  66.33 
 
 		 200 aa  278  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0978  TrpR binding protein WrbA  68.34 
 
 		 199 aa  277  7e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.642178  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  66.33 
 
 		 200 aa  277  8e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  62.81 
 
 		 200 aa  274  6e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0784  TrpR binding protein WrbA  68.84 
 
 		 199 aa  274  7e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  66.16 
 
 		 200 aa  273  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4506  TrpR binding protein WrbA  67.84 
 
 		 199 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860905  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  66.5 
 
 		 201 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2181  TrpR binding protein WrbA  67.17 
 
 		 199 aa  272  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3669  TrpR binding protein WrbA  65.33 
 
 		 199 aa  269  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196893 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1683  flavoprotein WrbA  68.69 
 
 		 207 aa  265  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.308348  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  64 
 
 		 199 aa  263  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8249  flavoprotein WrbA  69.35 
 
 		 199 aa  262  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.907663  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  66.67 
 
 		 201 aa  262  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4096  TrpR binding protein WrbA  63.82 
 
 		 199 aa  260  8.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.832118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  65.62 
 
 		 206 aa  259  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1023  flavoprotein WrbA  68.84 
 
 		 199 aa  259  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5226  TrpR binding protein WrbA  65.26 
 
 		 203 aa  257  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  61.5 
 
 		 200 aa  255  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  61.5 
 
 		 200 aa  255  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  60.4 
 
 		 203 aa  250  8.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4089  flavoprotein WrbA  63 
 
 		 199 aa  250  8.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1932  TrpR binding protein WrbA  69.04 
 
 		 199 aa  250  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.66734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  59.9 
 
 		 203 aa  249  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  60.2 
 
 		 203 aa  250  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0396  flavoprotein WrbA  64.29 
 
 		 212 aa  250  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4139  flavoprotein WrbA  64.14 
 
 		 198 aa  249  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000384114  unclonable  0.00000000000397831 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0608  TrpR binding protein WrbA  63.82 
 
 		 198 aa  241  3.9999999999999997e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1813  TrpR binding protein WrbA  62.12 
 
 		 199 aa  239  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000250234  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3134  TrpR binding protein WrbA  64 
 
 		 199 aa  239  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1078  TrpR binding protein WrbA  62.5 
 
 		 198 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1214  TrpR binding protein WrbA  62.5 
 
 		 198 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.332262 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1229  TrpR binding protein WrbA  62.5 
 
 		 198 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.570385 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1183  TrpR binding protein WrbA  62.5 
 
 		 198 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1194  TrpR binding protein WrbA  62.5 
 
 		 198 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2222  flavoprotein WrbA  65.99 
 
 		 203 aa  237  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01007  TrpR binding protein WrbA  62 
 
 		 198 aa  236  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2638  flavoprotein WrbA  62 
 
 		 198 aa  236  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.836437  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2591  TrpR binding protein WrbA  62 
 
 		 198 aa  236  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.172537 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1122  TrpR binding protein WrbA  62 
 
 		 198 aa  236  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98388  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2120  TrpR binding protein WrbA  62 
 
 		 198 aa  236  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01014  hypothetical protein  62 
 
 		 198 aa  236  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1117  TrpR binding protein WrbA  62 
 
 		 198 aa  236  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  56.93 
 
 		 204 aa  235  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  57.07 
 
 		 204 aa  235  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0373  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.6 
 
 		 202 aa  234  9e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267004  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3178  flavoprotein WrbA  59 
 
 		 204 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2261  TrpR binding protein WrbA  60 
 
 		 199 aa  231  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.999788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2043  TrpR binding protein WrbA  60 
 
 		 199 aa  231  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0806093  normal  0.0679166 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2363  TrpR binding protein WrbA  60 
 
 		 199 aa  231  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00380027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1242  TrpR binding protein WrbA  61 
 
 		 198 aa  231  5e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1341  TrpR binding protein WrbA  61.93 
 
 		 199 aa  231  8.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.357847  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00380  TrpR binding protein WrbA  60.61 
 
 		 198 aa  226  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1516  TrpR binding protein WrbA  61.5 
 
 		 198 aa  226  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.348571 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  53.43 
 
 		 204 aa  223  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  49.02 
 
 		 204 aa  212  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1914  TrpR binding protein WrbA  51.92 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.936643 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2234  flavoprotein WrbA  53.73 
 
 		 206 aa  202  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04350  cytoplasm protein, putative  48.15 
 
 		 340 aa  167  7e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.4788  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5355  flavoprotein WrbA  46.86 
 
 		 199 aa  167  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272087  normal  0.149509 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1050  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.57 
 
 		 202 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79909  predicted protein  44.5 
 
 		 277 aa  161  5.0000000000000005e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.147925 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85539  predicted protein  44.68 
 
 		 200 aa  161  6e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.08977 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31495  predicted protein  41.84 
 
 		 201 aa  158  5e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0157173  normal  0.0627326 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1973  flavodoxin/nitric oxide synthase  52.69 
 
 		 205 aa  155  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04556  tryptophan repressor binding protein  43.5 
 
 		 218 aa  155  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.816043  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44845  predicted protein  42.47 
 
 		 202 aa  154  8e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.357205  normal  0.0582237 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04240  cytoplasm protein, putative  42.63 
 
 		 211 aa  152  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.538448  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0896  flavoprotein WrbA  40.61 
 
 		 197 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5986  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):flavodoxin/nitric oxide synthase  44.33 
 
 		 208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00297  NADH-quinone oxidoreductase Pst2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02820)  40.74 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0359141  normal  0.396271 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1979  tryptophan repressor binding protein  45 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2990  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.81 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.991698  hitchhiker  0.0079617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>