39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4542 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4542  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  417  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2113  hypothetical protein  68.48 
 
 		 186 aa  264  7e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000937907 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0770  hypothetical protein  41.71 
 
 		 179 aa  144  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000800357 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0950  hypothetical protein  40.59 
 
 		 180 aa  128  5.0000000000000004e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.561046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1622  hypothetical protein  36.78 
 
 		 180 aa  124  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283408  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  36.42 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1956  flavodoxin  34.09 
 
 		 205 aa  115  5e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18440  hypothetical protein  34.71 
 
 		 174 aa  111  9e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0493479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  28.95 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1081  flavodoxin  32.34 
 
 		 225 aa  99  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.590464  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  28.82 
 
 		 196 aa  99  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32510  flavodoxin protein  32.52 
 
 		 197 aa  98.6  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752902  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  31.79 
 
 		 196 aa  97.1  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  37.91 
 
 		 172 aa  92  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  31.9 
 
 		 189 aa  89.7  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  31.4 
 
 		 159 aa  88.2  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  27.89 
 
 		 185 aa  88.2  8e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0656  twin-arginine translocation pathway signal  29.7 
 
 		 188 aa  87.8  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  32.17 
 
 		 186 aa  85.9  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2190  flavodoxin  30.22 
 
 		 221 aa  85.9  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2477  flavodoxin  30.91 
 
 		 221 aa  85.5  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0236789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2507  flavodoxin  31.51 
 
 		 228 aa  84.7  8e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2509  hypothetical protein  26.34 
 
 		 205 aa  84.7  9e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0445  flavodoxin  25.28 
 
 		 169 aa  84.3  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  27.98 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  27.91 
 
 		 160 aa  80.9  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1199  hypothetical protein  31.51 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.315921 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  29.93 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  30.23 
 
 		 159 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 		 428 aa  72.4  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  33.11 
 
 		 159 aa  72  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18190  flavodoxin  30.97 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  0.949186 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  27.91 
 
 		 489 aa  71.6  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0423  putative flavodoxin  28.87 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0214  putative flavodoxin  31.54 
 
 		 155 aa  64.7  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0944  hypothetical protein  30.46 
 
 		 158 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.025785  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  28.3 
 
 		 161 aa  53.1  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  27.87 
 
 		 163 aa  47.8  0.0001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  23.57 
 
 		 193 aa  45.4  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>