51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1081 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1081  flavodoxin  100 
 
 
225 aa  461  1e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.590464  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0770  hypothetical protein  43.75 
 
 
179 aa  149  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000800357 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0950  hypothetical protein  40.46 
 
 
180 aa  129  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.561046  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1956  flavodoxin  34.23 
 
 
205 aa  128  7.000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  34.02 
 
 
230 aa  122  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1622  hypothetical protein  39.43 
 
 
180 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283408  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  35.63 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18440  hypothetical protein  36.97 
 
 
174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0493479  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32510  flavodoxin protein  36.63 
 
 
197 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752902  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  35.06 
 
 
196 aa  108  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18190  flavodoxin  37.5 
 
 
157 aa  105  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  0.949186 
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  29.49 
 
 
186 aa  105  6e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  37.09 
 
 
160 aa  104  9e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  33.93 
 
 
189 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  36.91 
 
 
160 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2190  flavodoxin  30.65 
 
 
221 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2477  flavodoxin  30.65 
 
 
221 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0236789  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  30.86 
 
 
178 aa  103  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4542  hypothetical protein  32.34 
 
 
205 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  31.82 
 
 
185 aa  97.4  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.98 
 
 
428 aa  97.1  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2113  hypothetical protein  31.14 
 
 
186 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000937907 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1199  hypothetical protein  31.63 
 
 
224 aa  95.9  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.315921 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  36.31 
 
 
159 aa  95.1  7e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  30.43 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2507  flavodoxin  30.48 
 
 
228 aa  92.8  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0656  twin-arginine translocation pathway signal  33.92 
 
 
188 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  31.82 
 
 
172 aa  85.5  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  30 
 
 
159 aa  85.1  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2509  hypothetical protein  32.1 
 
 
205 aa  84.7  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  34.59 
 
 
161 aa  83.6  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  29.07 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  33.79 
 
 
163 aa  77.4  0.0000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  27.57 
 
 
193 aa  77  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  27.51 
 
 
489 aa  75.5  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0445  flavodoxin  28.68 
 
 
169 aa  72  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0423  putative flavodoxin  28.87 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0944  hypothetical protein  28.69 
 
 
158 aa  60.8  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.025785  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0214  putative flavodoxin  26.36 
 
 
155 aa  59.7  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16830  hypothetical protein  26.97 
 
 
164 aa  59.3  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.547063  normal  0.789104 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  24.86 
 
 
164 aa  58.5  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  25 
 
 
164 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  25 
 
 
164 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1980  hypothetical protein  30.05 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.838314  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  29.41 
 
 
162 aa  47.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2081  hypothetical protein  28.57 
 
 
128 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0160966  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  22.67 
 
 
164 aa  46.6  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  28.93 
 
 
178 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
164 aa  43.5  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  19.34 
 
 
173 aa  43.5  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  28.79 
 
 
175 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>