50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1622 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1622  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  377  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283408  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0950  hypothetical protein  74.3 
 
 		 180 aa  285  2.9999999999999996e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.561046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0770  hypothetical protein  65.54 
 
 		 179 aa  262  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000800357 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  56.21 
 
 		 230 aa  204  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18440  hypothetical protein  50.59 
 
 		 174 aa  183  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0493479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  44.19 
 
 		 196 aa  153  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1956  flavodoxin  43.02 
 
 		 205 aa  152  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  40.94 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2507  flavodoxin  39.56 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  43.37 
 
 		 172 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  41.78 
 
 		 186 aa  135  4e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  38.15 
 
 		 178 aa  134  6.0000000000000005e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  36.84 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2113  hypothetical protein  39.88 
 
 		 186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000937907 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4542  hypothetical protein  36.78 
 
 		 205 aa  124  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  39.46 
 
 		 160 aa  124  8.000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1081  flavodoxin  39.43 
 
 		 225 aa  120  9e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.590464  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2477  flavodoxin  37.64 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0236789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2190  flavodoxin  36.61 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  36.97 
 
 		 489 aa  118  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2509  hypothetical protein  32.24 
 
 		 205 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1199  hypothetical protein  36.73 
 
 		 224 aa  112  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.315921 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32510  flavodoxin protein  34.32 
 
 		 197 aa  107  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752902  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0445  flavodoxin  30 
 
 		 169 aa  104  5e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0656  twin-arginine translocation pathway signal  31.74 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  31.55 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  33.13 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  31.55 
 
 		 196 aa  99  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0423  putative flavodoxin  34.97 
 
 		 153 aa  95.9  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  34.29 
 
 		 159 aa  94.7  6e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  35.21 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  30.29 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 		 428 aa  84  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0214  putative flavodoxin  32.03 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18190  flavodoxin  29.48 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  0.949186 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  31.07 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  36.97 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  36.13 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  36.67 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16830  hypothetical protein  33.87 
 
 		 164 aa  60.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.547063  normal  0.789104 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  25.85 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0944  hypothetical protein  35.71 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.025785  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2081  hypothetical protein  33.7 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0160966  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  24 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  29.17 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  28.95 
 
 		 193 aa  50.8  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  48.1  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  25 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  25 
 
 		 170 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1980  hypothetical protein  25.74 
 
 		 218 aa  41.6  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.838314  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>