64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1078 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  100 
 
 		 221 aa  450  1.0000000000000001e-126  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  38.8 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  43.45 
 
 		 186 aa  129  3e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  38.61 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32510  flavodoxin protein  41.13 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752902  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0770  hypothetical protein  34.92 
 
 		 179 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000800357 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  37.96 
 
 		 172 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  35.88 
 
 		 160 aa  118  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  34.71 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0656  twin-arginine translocation pathway signal  36.69 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  33.1 
 
 		 196 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4542  hypothetical protein  28.95 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1956  flavodoxin  32.26 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2509  hypothetical protein  33.13 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1199  hypothetical protein  25 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.315921 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1622  hypothetical protein  31.55 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283408  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  32.35 
 
 		 160 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18440  hypothetical protein  34.84 
 
 		 174 aa  100  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0493479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  35.57 
 
 		 178 aa  97.4  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0445  flavodoxin  32.02 
 
 		 169 aa  96.3  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18190  flavodoxin  34.51 
 
 		 157 aa  95.9  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  0.949186 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1081  flavodoxin  30.43 
 
 		 225 aa  95.5  6e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.590464  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2113  hypothetical protein  28.33 
 
 		 186 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000937907 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  36.67 
 
 		 489 aa  94.4  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0950  hypothetical protein  33.12 
 
 		 180 aa  94  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.561046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2477  flavodoxin  30.52 
 
 		 221 aa  92  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0236789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2190  flavodoxin  27.04 
 
 		 221 aa  92  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2507  flavodoxin  36.61 
 
 		 228 aa  89.4  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  33.79 
 
 		 159 aa  85.1  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  27.59 
 
 		 159 aa  81.3  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  33.93 
 
 		 164 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  33.93 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0423  putative flavodoxin  31.85 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0214  putative flavodoxin  29.58 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  25.43 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  32.74 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.28 
 
 		 428 aa  72.8  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  25.81 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  31.2 
 
 		 163 aa  64.7  0.000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  34.34 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0944  hypothetical protein  30.28 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.025785  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  25.84 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  29.63 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  29.17 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16830  hypothetical protein  30.97 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.547063  normal  0.789104 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  25.38 
 
 		 175 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1980  hypothetical protein  28.24 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.838314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  29.69 
 
 		 170 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  22.83 
 
 		 175 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2633  flavodoxin  30.65 
 
 		 141 aa  49.3  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215143  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  24.32 
 
 		 173 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  33 
 
 		 178 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1724  ATPase  25.13 
 
 		 194 aa  45.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2187  hypothetical protein  28.68 
 
 		 173 aa  45.1  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.772007  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2384  hypothetical protein  28.57 
 
 		 161 aa  44.7  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4564  hypothetical protein  26.26 
 
 		 176 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4431  hypothetical protein  26.26 
 
 		 176 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1212  hypothetical protein  27.27 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189155  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 297 aa  43.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0187  hypothetical protein  23.6 
 
 		 176 aa  42.4  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0330126 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2453  hypothetical protein  23.19 
 
 		 163 aa  41.6  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00273719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>