51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1980 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1980  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  450  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.838314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  28.8 
 
 		 170 aa  72  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  26.67 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  33.07 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0214  putative flavodoxin  29.1 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  25.29 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.43 
 
 		 428 aa  62  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  30.58 
 
 		 489 aa  61.6  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  34.62 
 
 		 160 aa  60.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  35.19 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  28.76 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0423  putative flavodoxin  30.95 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  28.87 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0482  ArsR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  31.97 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  27.64 
 
 		 175 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  25.62 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32510  flavodoxin protein  33.33 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752902  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  28.15 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  25.49 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 297 aa  53.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  28.45 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1199  hypothetical protein  26.67 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.315921 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18190  flavodoxin  32.43 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  0.949186 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0712  ArsR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 160 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  30.08 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0770  hypothetical protein  30.7 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000800357 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2507  flavodoxin  28.07 
 
 		 228 aa  48.5  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  26.14 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18440  hypothetical protein  27.88 
 
 		 174 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0493479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  27.36 
 
 		 162 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  26.21 
 
 		 161 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1081  flavodoxin  29.53 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.590464  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  29.36 
 
 		 159 aa  45.8  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0656  twin-arginine translocation pathway signal  28.83 
 
 		 188 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  26.42 
 
 		 164 aa  45.1  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  26.42 
 
 		 164 aa  45.1  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3000  hypothetical protein  28.09 
 
 		 143 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000872751  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5938  putative flavodoxin  21.93 
 
 		 177 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  24.53 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  25.98 
 
 		 161 aa  43.1  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  24.5 
 
 		 173 aa  43.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  30.4 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2509  hypothetical protein  25 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1284  hypothetical protein  30.77 
 
 		 163 aa  42.7  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201836  normal  0.37398 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1956  flavodoxin  28.16 
 
 		 205 aa  42  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1207  flavodoxin FldA  35.62 
 
 		 175 aa  42.4  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000563354  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1622  hypothetical protein  25.74 
 
 		 180 aa  41.6  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283408  normal  0.179064 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>