35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2384 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2384  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  320  7e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0903  hypothetical protein  42.48 
 
 		 157 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000048234 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0712  ArsR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  31.71 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  30.89 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  31.71 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1284  hypothetical protein  26.81 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201836  normal  0.37398 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  28.72 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0482  ArsR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  26.98 
 
 		 161 aa  52  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  29.69 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  29.73 
 
 		 186 aa  48.9  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  29.06 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  29.17 
 
 		 191 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 297 aa  47.8  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  28.08 
 
 		 193 aa  47.4  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  28.3 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2187  hypothetical protein  29.2 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.772007  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  26.61 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0187  hypothetical protein  30.43 
 
 		 176 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0330126 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  27.87 
 
 		 178 aa  44.7  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4431  hypothetical protein  29.57 
 
 		 176 aa  44.3  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4564  hypothetical protein  29.57 
 
 		 176 aa  44.3  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  25.21 
 
 		 178 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  19.85 
 
 		 161 aa  44.3  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  28.83 
 
 		 221 aa  44.3  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  36.9 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2094  hypothetical protein  29.82 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175818  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  23.53 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2190  flavodoxin  25.6 
 
 		 221 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  27.08 
 
 		 173 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2477  flavodoxin  25.6 
 
 		 221 aa  42.4  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0236789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  25.41 
 
 		 196 aa  42  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  27.85 
 
 		 164 aa  41.2  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>