51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2190 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2190  flavodoxin  100 
 
 		 221 aa  458  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2477  flavodoxin  99.55 
 
 		 221 aa  455  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0236789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2081  hypothetical protein  98.41 
 
 		 128 aa  251  8.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0160966  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0770  hypothetical protein  39.57 
 
 		 179 aa  150  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000800357 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1956  flavodoxin  36.32 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  35.29 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2507  flavodoxin  35.48 
 
 		 228 aa  135  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  45.04 
 
 		 230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  36.7 
 
 		 196 aa  128  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0950  hypothetical protein  36.61 
 
 		 180 aa  122  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.561046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1622  hypothetical protein  36.61 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283408  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  38.62 
 
 		 178 aa  119  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18440  hypothetical protein  35.54 
 
 		 174 aa  115  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0493479  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  36.11 
 
 		 489 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2509  hypothetical protein  29.05 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1199  hypothetical protein  38.17 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.315921 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  34.01 
 
 		 160 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18190  flavodoxin  33.77 
 
 		 157 aa  107  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  0.949186 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  33.33 
 
 		 160 aa  105  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  34.03 
 
 		 185 aa  104  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1081  flavodoxin  30.65 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.590464  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32510  flavodoxin protein  40.34 
 
 		 197 aa  101  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752902  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  29.67 
 
 		 196 aa  97.1  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  39.17 
 
 		 189 aa  97.1  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  29.89 
 
 		 172 aa  94.7  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  32.26 
 
 		 159 aa  93.6  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2113  hypothetical protein  30.59 
 
 		 186 aa  92.8  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000937907 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  30.52 
 
 		 221 aa  92.4  5e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.64 
 
 		 428 aa  90.5  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0656  twin-arginine translocation pathway signal  34.45 
 
 		 188 aa  88.6  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0445  flavodoxin  29.73 
 
 		 169 aa  87  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4542  hypothetical protein  30.59 
 
 		 205 aa  85.9  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  30.92 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  31.76 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  34 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  31.08 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0214  putative flavodoxin  30.82 
 
 		 155 aa  77.4  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  30.41 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  27.05 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0423  putative flavodoxin  29.45 
 
 		 153 aa  72  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  32.03 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16830  hypothetical protein  30.46 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.547063  normal  0.789104 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  25.32 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0712  ArsR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 160 aa  52  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  25.49 
 
 		 162 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  22 
 
 		 161 aa  49.3  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0944  hypothetical protein  25.93 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.025785  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2384  hypothetical protein  25.6 
 
 		 161 aa  42.4  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 164 aa  42.4  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0608  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.45 
 
 		 194 aa  42.4  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.31 
 
 		 275 aa  41.6  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>