48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1956 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1956  flavodoxin  100 
 
 
205 aa  426  1e-118  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0770  hypothetical protein  46.96 
 
 
179 aa  178  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000800357 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0950  hypothetical protein  44.13 
 
 
180 aa  160  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.561046  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  35.68 
 
 
230 aa  155  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1622  hypothetical protein  43.02 
 
 
180 aa  152  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283408  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18440  hypothetical protein  41.95 
 
 
174 aa  142  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0493479  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2477  flavodoxin  37.14 
 
 
221 aa  142  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0236789  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2190  flavodoxin  36.32 
 
 
221 aa  140  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  40.96 
 
 
196 aa  137  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1081  flavodoxin  37.93 
 
 
225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.590464  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2113  hypothetical protein  38.07 
 
 
186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000937907 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2507  flavodoxin  35.83 
 
 
228 aa  120  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  50.93 
 
 
178 aa  120  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32510  flavodoxin protein  33.67 
 
 
197 aa  119  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752902  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4542  hypothetical protein  34.09 
 
 
205 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  33.17 
 
 
186 aa  108  7.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  29.31 
 
 
185 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  33.71 
 
 
221 aa  105  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  31.03 
 
 
189 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0656  twin-arginine translocation pathway signal  32.12 
 
 
188 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2509  hypothetical protein  29.25 
 
 
205 aa  99  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  31.95 
 
 
196 aa  97.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  36.09 
 
 
489 aa  96.3  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  34.48 
 
 
159 aa  95.1  7e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1199  hypothetical protein  32.39 
 
 
224 aa  94.7  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.315921 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0445  flavodoxin  30.11 
 
 
169 aa  94.4  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  34.42 
 
 
160 aa  92  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  30.41 
 
 
160 aa  90.9  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18190  flavodoxin  32.02 
 
 
157 aa  90.5  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  0.949186 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  32.77 
 
 
159 aa  89.7  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  33.33 
 
 
172 aa  88.2  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.09 
 
 
428 aa  87.4  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  33.77 
 
 
159 aa  82  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  24.2 
 
 
161 aa  71.2  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0423  putative flavodoxin  33.94 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  28.03 
 
 
163 aa  63.2  0.000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0214  putative flavodoxin  30.28 
 
 
155 aa  62  0.000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  28.77 
 
 
164 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2081  hypothetical protein  31.3 
 
 
128 aa  58.9  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0160966  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  28.38 
 
 
164 aa  58.9  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  27.4 
 
 
164 aa  58.2  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  25.59 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  29.25 
 
 
162 aa  54.7  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  29.46 
 
 
161 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16830  hypothetical protein  32.99 
 
 
164 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.547063  normal  0.789104 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0944  hypothetical protein  26.01 
 
 
158 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.025785  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  21.05 
 
 
173 aa  43.5  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1980  hypothetical protein  28.16 
 
 
218 aa  42  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.838314  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>