19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2081 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2081  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  260  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0160966  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2477  flavodoxin  99.21 
 
 		 221 aa  254  4e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0236789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2190  flavodoxin  98.41 
 
 		 221 aa  251  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  32.14 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0770  hypothetical protein  35.71 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000800357 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1956  flavodoxin  31.3 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2509  hypothetical protein  27.19 
 
 		 205 aa  57.4  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  28.57 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1622  hypothetical protein  33.7 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283408  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  45.45 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2507  flavodoxin  31.96 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0950  hypothetical protein  33.71 
 
 		 180 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.561046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18440  hypothetical protein  31.82 
 
 		 174 aa  47.4  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0493479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  29.17 
 
 		 196 aa  47.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  34.55 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1199  hypothetical protein  39.66 
 
 		 224 aa  47.4  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.315921 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1081  flavodoxin  28.57 
 
 		 225 aa  46.6  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.590464  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  25.81 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  36.36 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>