90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1078 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  100 
 
 		 172 aa  356  8e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  55 
 
 		 230 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  53.59 
 
 		 160 aa  180  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  48.63 
 
 		 186 aa  164  5.9999999999999996e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  48.72 
 
 		 196 aa  164  5.9999999999999996e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  53.21 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  43.12 
 
 		 178 aa  151  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0770  hypothetical protein  43.86 
 
 		 179 aa  147  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000800357 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0423  putative flavodoxin  50.37 
 
 		 153 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  47.02 
 
 		 189 aa  143  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0950  hypothetical protein  40.68 
 
 		 180 aa  139  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.561046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0214  putative flavodoxin  43.62 
 
 		 155 aa  137  1e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  41.25 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1622  hypothetical protein  43.37 
 
 		 180 aa  135  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283408  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  44.3 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  40.26 
 
 		 196 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32510  flavodoxin protein  42.21 
 
 		 197 aa  131  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752902  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0656  twin-arginine translocation pathway signal  46.62 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0445  flavodoxin  38.04 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  37.41 
 
 		 221 aa  118  3.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1199  hypothetical protein  35.71 
 
 		 224 aa  112  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.315921 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  39.07 
 
 		 489 aa  110  8.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2507  flavodoxin  38.62 
 
 		 228 aa  107  7.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18440  hypothetical protein  34.12 
 
 		 174 aa  98.2  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0493479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2477  flavodoxin  29.89 
 
 		 221 aa  94.7  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0236789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2190  flavodoxin  29.89 
 
 		 221 aa  94.7  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4542  hypothetical protein  37.91 
 
 		 205 aa  92  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  37.78 
 
 		 159 aa  91.3  6e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18190  flavodoxin  32.05 
 
 		 157 aa  88.6  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  0.949186 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1956  flavodoxin  33.33 
 
 		 205 aa  88.2  5e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2509  hypothetical protein  29.27 
 
 		 205 aa  87.8  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1081  flavodoxin  31.82 
 
 		 225 aa  85.1  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.590464  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2113  hypothetical protein  32.09 
 
 		 186 aa  84.7  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000937907 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  31.41 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16830  hypothetical protein  32.61 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.547063  normal  0.789104 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.75 
 
 		 428 aa  74.3  0.0000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  28.3 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  28.57 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0944  hypothetical protein  29.56 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.025785  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  31.58 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  28.75 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  29.2 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  26.88 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  28.46 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  29.32 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  31.3 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1980  hypothetical protein  31.97 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.838314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  24.39 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  25 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  32.41 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  25.89 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1106  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.82 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.796872  normal  0.0316992 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3607  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.48 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1205  flavodoxin family protein  30.61 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2187  hypothetical protein  29.1 
 
 		 173 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.772007  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  27.27 
 
 		 175 aa  52  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  29.17 
 
 		 175 aa  51.2  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0712  ArsR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0903  hypothetical protein  31.25 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000048234 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0705  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.33 
 
 		 220 aa  47.8  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1474  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2453  hypothetical protein  26.4 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00273719  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2081  hypothetical protein  25.81 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0160966  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 297 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51990  Trp repressor binding protein WrbA  29.37 
 
 		 198 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164992 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002786  Trp repressor-binding protein  26.6 
 
 		 189 aa  44.7  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3716  hypothetical protein  25.6 
 
 		 176 aa  44.3  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0187  hypothetical protein  25.37 
 
 		 176 aa  44.3  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0330126 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.56 
 
 		 158 aa  44.3  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1558  TRP repressor binding protein  27.08 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4431  hypothetical protein  23.62 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4564  hypothetical protein  23.62 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03195  hypothetical protein  25.53 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2247  flavoprotein WrbA  26.35 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32110  flavodoxin FldA  29.09 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5938  putative flavodoxin  21.15 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2384  hypothetical protein  23.53 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1740  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.26 
 
 		 281 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00299505  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2521  Trp repressor-binding protein  29.27 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1990  copper-translocating P-type ATPase  30.17 
 
 		 820 aa  42.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0608  TrpR binding protein WrbA  29.9 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1686  trp repressor binding protein  25.81 
 
 		 201 aa  41.6  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1860  flavoprotein WrbA  28.19 
 
 		 203 aa  41.6  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000177757 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0715  flavoprotein WrbA  26.45 
 
 		 197 aa  41.6  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.358899 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1665  flavoprotein WrbA  28.08 
 
 		 197 aa  41.2  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204501  hitchhiker  0.00540913 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 164 aa  41.2  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2633  flavodoxin  22.9 
 
 		 141 aa  41.2  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3384  hypothetical protein  24.35 
 
 		 224 aa  40.8  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732427  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0482  ArsR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 163 aa  40.8  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3703  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.88 
 
 		 201 aa  40.8  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36830  WrbA-like flavodoxin  27.87 
 
 		 200 aa  40.8  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.740574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>