21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3716 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3716  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  357  4e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1212  hypothetical protein  50.86 
 
 		 179 aa  170  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189155  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0187  hypothetical protein  43.75 
 
 		 176 aa  164  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0330126 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4564  hypothetical protein  43.75 
 
 		 176 aa  158  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4431  hypothetical protein  43.75 
 
 		 176 aa  158  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1509  hypothetical protein  46.94 
 
 		 106 aa  92  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  30.52 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  32.64 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  34.65 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  30.77 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2094  hypothetical protein  31.91 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175818  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1745  hypothetical protein  32.09 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  31.2 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2187  hypothetical protein  29.85 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.772007  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5938  putative flavodoxin  29.81 
 
 		 177 aa  52.4  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3000  hypothetical protein  25.84 
 
 		 143 aa  47.8  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000872751  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1510  hypothetical protein  36.11 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2453  hypothetical protein  26.88 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00273719  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  25.6 
 
 		 172 aa  44.3  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  27.91 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0351  pyruvate carboxyltransferase  25.66 
 
 		 142 aa  41.2  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.63457  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>