36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4564 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4431  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  361  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4564  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  361  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0187  hypothetical protein  84.09 
 
 		 176 aa  311  2.9999999999999996e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0330126 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1212  hypothetical protein  52.57 
 
 		 179 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189155  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3716  hypothetical protein  43.75 
 
 		 176 aa  158  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1509  hypothetical protein  70.59 
 
 		 106 aa  144  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1510  hypothetical protein  65.28 
 
 		 72 aa  99  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  30.36 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  27.33 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  28.46 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  24.68 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5938  putative flavodoxin  25 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  26.42 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3000  hypothetical protein  32.29 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000872751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  30.89 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0351  pyruvate carboxyltransferase  27.27 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.63457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2187  hypothetical protein  30.2 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.772007  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  28.18 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  27.52 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  28.18 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1745  hypothetical protein  30.92 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  28.24 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  25.45 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  24.81 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2094  hypothetical protein  27.85 
 
 		 173 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175818  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2633  flavodoxin  20.66 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215143  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  21.26 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2384  hypothetical protein  29.57 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  26.26 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  23.62 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  23.81 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  21.6 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0214  putative flavodoxin  26.77 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  21.32 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1249  NADPH-dependent FMN reductase:flavodoxin/nitric oxide synthase  29.79 
 
 		 200 aa  40.8  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.905  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0423  putative flavodoxin  28.57 
 
 		 153 aa  40.8  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>