295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2521 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2521  Trp repressor-binding protein  100 
 
 
205 aa  412  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2990  flavodoxin/nitric oxide synthase  67.17 
 
 
198 aa  259  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.991698  hitchhiker  0.0079617 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2247  flavoprotein WrbA  64.43 
 
 
205 aa  257  7e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0408  trp repressor binding protein  65.8 
 
 
197 aa  257  9e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1766  NAD(P)H:quinone oxidoreductase, type IV  65.8 
 
 
197 aa  257  9e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  65.31 
 
 
200 aa  253  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.938759  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4229  flavodoxin/nitric oxide synthase  65.66 
 
 
198 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234243  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0913  flavodoxin/nitric oxide synthase  64.43 
 
 
203 aa  249  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0705  flavodoxin/nitric oxide synthase  62 
 
 
220 aa  249  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1474  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1246  flavoprotein WrbA  64.77 
 
 
201 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000168945 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1644  trp repressor binding protein  64.47 
 
 
201 aa  248  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4073  flavodoxin/nitric oxide synthase  64.47 
 
 
201 aa  248  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1206  flavoprotein WrbA  63.45 
 
 
201 aa  247  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3703  flavodoxin/nitric oxide synthase  64.29 
 
 
201 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1897  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.27 
 
 
209 aa  245  4e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4560  Trp repressor binding protein WrbA  64.95 
 
 
198 aa  245  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.309608  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1130  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.73 
 
 
209 aa  244  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0057993  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0899  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  61.86 
 
 
199 aa  244  8e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000786086 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36830  WrbA-like flavodoxin  67.51 
 
 
200 aa  244  8e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.740574  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1249  NADPH-dependent FMN reductase:flavodoxin/nitric oxide synthase  61.81 
 
 
200 aa  242  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51990  Trp repressor binding protein WrbA  64.8 
 
 
198 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164992 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1336  flavodoxin/nitric oxide synthase  64.89 
 
 
206 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.481655  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1686  trp repressor binding protein  63.27 
 
 
201 aa  240  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1861  flavodoxin  60.5 
 
 
687 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697937  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1823  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.66 
 
 
199 aa  237  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1558  TRP repressor binding protein  60.62 
 
 
201 aa  236  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1684  NADPH-dependent FMN reductase  60.71 
 
 
202 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.866798  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1665  flavoprotein WrbA  60.1 
 
 
197 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204501  hitchhiker  0.00540913 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0941  flavodoxin  61.03 
 
 
202 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1706  NADPH-dependent FMN reductase  61.03 
 
 
202 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0407  flavodoxin  61.03 
 
 
202 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1376  flavoprotein WrbA  64.32 
 
 
206 aa  235  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.79766 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0973  flavodoxin/nitric oxide synthase  63.3 
 
 
206 aa  235  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0780306  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0755  flavodoxin  61.03 
 
 
202 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383175  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1433  flavoprotein WrbA  63.3 
 
 
206 aa  235  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1474  flavodoxin  61.03 
 
 
202 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1455  flavodoxin/nitric oxide synthase  63.3 
 
 
206 aa  235  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1979  tryptophan repressor binding protein  62.37 
 
 
197 aa  234  5.0000000000000005e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1995  flavoprotein WrbA  60.62 
 
 
197 aa  234  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2774  flavoprotein WrbA  59.69 
 
 
200 aa  234  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1860  flavoprotein WrbA  63.78 
 
 
203 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000177757 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0700  hypothetical protein  59.39 
 
 
199 aa  233  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4600  flavodoxin/nitric oxide synthase  63.24 
 
 
206 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573755  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1353  putative Trp repressor binding protein  59.18 
 
 
200 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.873787  normal  0.272914 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04556  tryptophan repressor binding protein  62.24 
 
 
218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.816043  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0867  flavoprotein WrbA  58.79 
 
 
202 aa  232  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0748564  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0715  flavoprotein WrbA  60.82 
 
 
197 aa  232  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.358899 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2619  flavodoxin  60.51 
 
 
202 aa  232  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0980  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.28 
 
 
202 aa  231  5e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0439  tryptophan repressor binding protein  60.91 
 
 
199 aa  231  8.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0384  flavoprotein WrbA  60.91 
 
 
199 aa  230  1e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0682  hypothetical protein  58.88 
 
 
199 aa  228  5e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0737  flavoprotein WrbA  56.77 
 
 
197 aa  225  4e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.438501  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2485  flavodoxin/nitric oxide synthase  58.97 
 
 
198 aa  225  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1746  Trp repressor-binding protein  60.73 
 
 
186 aa  222  4e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0631  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.22 
 
 
212 aa  221  6e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2779  flavoprotein WrbA  56.35 
 
 
199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1576  flavoprotein WrbA  60.82 
 
 
202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2340  flavodoxin/nitric oxide synthase  51.81 
 
 
200 aa  218  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0200739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0520  flavodoxin/nitric oxide synthase  66.27 
 
 
184 aa  216  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0558  flavoprotein WrbA  57.36 
 
 
205 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.731292  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03195  hypothetical protein  58.25 
 
 
190 aa  214  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002786  Trp repressor-binding protein  58.33 
 
 
189 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0549  putative Trp repressor binding protein  57.81 
 
 
205 aa  206  2e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02144  Flavodoxin/nitric oxide synthase  55.05 
 
 
200 aa  206  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0314978  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0537  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.25 
 
 
205 aa  201  4e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00888496 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3069  flavodoxin-like protein  54.36 
 
 
198 aa  199  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.432129  hitchhiker  0.00072414 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0428  NADPH-dependent FMN reductase  41.54 
 
 
197 aa  151  5.9999999999999996e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  43.08 
 
 
199 aa  150  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0896  flavoprotein WrbA  40.51 
 
 
197 aa  150  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  43.84 
 
 
203 aa  149  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  42.35 
 
 
200 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  41.84 
 
 
200 aa  148  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  41.33 
 
 
200 aa  148  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  41.84 
 
 
200 aa  148  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  41.84 
 
 
200 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  43.65 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  41.84 
 
 
200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  42.08 
 
 
203 aa  144  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  42.16 
 
 
204 aa  144  6e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  41.33 
 
 
200 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0373  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.78 
 
 
202 aa  143  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267004  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  41.92 
 
 
200 aa  142  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1683  flavoprotein WrbA  43.5 
 
 
207 aa  142  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.308348  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0396  flavoprotein WrbA  44.5 
 
 
212 aa  142  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  40 
 
 
204 aa  142  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  42.93 
 
 
200 aa  140  9e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  42.08 
 
 
204 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  41.45 
 
 
200 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  40.51 
 
 
201 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  42.71 
 
 
201 aa  137  8.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  41.29 
 
 
204 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  41 
 
 
212 aa  136  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1650  TrpR binding protein WrbA  41.62 
 
 
199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207552  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4089  flavoprotein WrbA  42.35 
 
 
199 aa  135  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3216  flavoprotein WrbA  39.39 
 
 
199 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103808 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2181  TrpR binding protein WrbA  40.61 
 
 
199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  41.62 
 
 
200 aa  132  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  41.62 
 
 
200 aa  132  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  43.56 
 
 
199 aa  132  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>