37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0482 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0482  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 163 aa  340  5e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0712  ArsR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 160 aa  105  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 297 aa  102  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1284  hypothetical protein  29.38 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201836  normal  0.37398 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2633  flavodoxin  25.56 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215143  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  31.36 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  27.92 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  33.93 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1980  hypothetical protein  31.46 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.838314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  30.7 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  27.98 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2384  hypothetical protein  25.35 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  28.44 
 
 		 186 aa  51.2  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  30 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  32.91 
 
 		 164 aa  48.1  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  27.5 
 
 		 178 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  30.95 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  29.17 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  31.31 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0351  pyruvate carboxyltransferase  31.67 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.63457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0903  hypothetical protein  26.58 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000048234 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  27.13 
 
 		 175 aa  44.7  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5938  putative flavodoxin  26.96 
 
 		 177 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1501  flavodoxin  28.7 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1291  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.7 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3241  twin-arginine translocation pathway signal  26.36 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  23.45 
 
 		 175 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  24.83 
 
 		 159 aa  42  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  27.73 
 
 		 159 aa  42  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3899  twin-arginine translocation pathway signal  26.98 
 
 		 196 aa  42  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.942744  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1254  TRP repressor binding protein  27.27 
 
 		 200 aa  41.6  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.128964  normal  0.538833 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  25.66 
 
 		 160 aa  41.2  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  26.89 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32510  flavodoxin protein  29.92 
 
 		 197 aa  40.8  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752902  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18440  hypothetical protein  26.71 
 
 		 174 aa  40.8  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0493479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1740  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.55 
 
 		 281 aa  40.4  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00299505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>