31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1501 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1501  flavodoxin  100 
 
 		 144 aa  290  3e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1291  flavodoxin/nitric oxide synthase  98.61 
 
 		 144 aa  286  5.0000000000000004e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0995  hypothetical protein  30.77 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1615  hypothetical protein  28.65 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5352  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.74 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3477  hypothetical protein  32.93 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.969721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1893  hypothetical protein  28.33 
 
 		 165 aa  57  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.227105  normal  0.274153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1002  hypothetical protein  30.23 
 
 		 184 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3822  hypothetical protein  25 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3013  hypothetical protein  27.22 
 
 		 169 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.778311  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1259  flavodoxin  26.8 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0610  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  30.95 
 
 		 323 aa  45.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.828743  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1113  hypothetical protein  27.11 
 
 		 174 aa  44.3  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.258741  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0077  flavodoxin-like protein  24.81 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0482  ArsR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 163 aa  43.5  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280132  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0804  flavodoxin  32.47 
 
 		 402 aa  43.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0646  flavodoxin family protein  30.7 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0964  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.77 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0186557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2438  Flavodoxin-like protein  37.66 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000794828  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1269  flavodoxin FldA  29.01 
 
 		 162 aa  41.6  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.829769  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  33.33 
 
 		 195 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1384  flavodoxin FldA  28.33 
 
 		 163 aa  41.6  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000670293  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0589  flavodoxin family protein  26.55 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1573  flavodoxin FldA  28.33 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.698699  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0185  hypothetical protein  29.55 
 
 		 335 aa  41.2  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.533354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  30.63 
 
 		 200 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1683  flavoprotein WrbA  24.06 
 
 		 207 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.308348  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0268  flavodoxin FldA  27.97 
 
 		 163 aa  40.4  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  29.73 
 
 		 199 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  29.73 
 
 		 199 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1943  hypothetical protein  27.78 
 
 		 190 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.23775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>