262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1254 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1254  TRP repressor binding protein  100 
 
 		 200 aa  417  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.128964  normal  0.538833 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1129  flavodoxin/nitric oxide synthase  83.33 
 
 		 205 aa  353  1e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1570  NADPH-dependent FMN reductase  66.49 
 
 		 213 aa  271  5.000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.101574  hitchhiker  0.00239279 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3284  NADPH-dependent FMN reductase  44.92 
 
 		 192 aa  162  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.951999 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3113  flavodoxin domain-containing protein  41.76 
 
 		 237 aa  158  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2589  flavodoxin domain-containing protein  42.31 
 
 		 191 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1966  flavodoxin domain-containing protein  42.31 
 
 		 191 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.952042  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0022  flavodoxin domain-containing protein  42.31 
 
 		 264 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3792  tryptophan repressor binding protein  42.31 
 
 		 191 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0417483  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3520  flavodoxin domain-containing protein  42.31 
 
 		 191 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3854  tryptophan repressor binding protein  42.31 
 
 		 191 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3127  flavodoxin domain-containing protein  42.31 
 
 		 191 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3529  multimeric flavodoxin WrbA  42.31 
 
 		 191 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0295  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.93 
 
 		 190 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000113497 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0633  putative TRP repressor binding protein  46.33 
 
 		 190 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0416  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.85 
 
 		 189 aa  152  4e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.43833  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3414  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.86 
 
 		 190 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0476  tryptophan repressor binding protein  43.85 
 
 		 189 aa  151  7e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0234  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.39 
 
 		 190 aa  151  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2874  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.63 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00256934  hitchhiker  0.000000000000114365 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0242  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.39 
 
 		 190 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  hitchhiker  0.00000000952931 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2791  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.76 
 
 		 190 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0315  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.76 
 
 		 190 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2405  putative TRP repressor binding protein-like protein  42.29 
 
 		 190 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.570978  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2207  putative TRP repressor binding protein  41.14 
 
 		 190 aa  141  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.503271 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2011  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.29 
 
 		 190 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1959  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.57 
 
 		 189 aa  141  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  38.8 
 
 		 188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0278  flavoprotein  41.01 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000962932 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1090  NADPH-dependent FMN reductase  40.11 
 
 		 213 aa  135  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.665175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3679  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.7 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0287676  hitchhiker  0.00000000000590116 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4867  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.21 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392234  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2888  tryptophan repressor-binding protein  39.66 
 
 		 184 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.386778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5160  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.14 
 
 		 190 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.65126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4944  hypothetical protein  37.77 
 
 		 203 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1709  NADPH-dependent FMN reductase  45.1 
 
 		 189 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0120762  normal  0.0625376 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2449  tryptophan repressor binding protein  35.78 
 
 		 218 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3121  putative flavodoxin  39.33 
 
 		 183 aa  127  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197452  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2573  putative flavodoxin  40 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.620204  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2749  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.57 
 
 		 184 aa  124  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2899  putative flavodoxin  38.25 
 
 		 184 aa  123  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0041  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.22 
 
 		 184 aa  123  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2456  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.87 
 
 		 184 aa  122  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1522  putative flavodoxin  38.07 
 
 		 184 aa  122  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3028  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.71 
 
 		 184 aa  121  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4769  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.92 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4981  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.43 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1180  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.63 
 
 		 183 aa  118  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  36.67 
 
 		 186 aa  118  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3582  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.16 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105689  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2929  putative flavodoxin  38.59 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2551  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.57 
 
 		 184 aa  115  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  39.34 
 
 		 195 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0456  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.41 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4044  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.31 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03044  tryptophan repressor binding protein  34.92 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6542  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.29 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381266 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3424  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.72 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22540  putative flavodoxin  36.99 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000135401  hitchhiker  0.0000186487 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5693  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.29 
 
 		 196 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6057  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.29 
 
 		 196 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4063  hypothetical protein  36.76 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0979244  normal  0.350489 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0487  multimeric flavodoxin  42.86 
 
 		 159 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4521  hypothetical protein  36.22 
 
 		 196 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0923053  normal  0.429536 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1421  NADPH-dependent FMN reductase  35.05 
 
 		 187 aa  106  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.9217  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0554  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.53 
 
 		 184 aa  104  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.519186 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001005  multimeric flavodoxin WrbA  33.68 
 
 		 194 aa  104  9e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3518  multimeric flavodoxin WrbA  34.43 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1044  tryptophan repressor binding protein  36.16 
 
 		 178 aa  95.1  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1213  tryptophan repressor binding protein  38.5 
 
 		 205 aa  94.7  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0487623 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07059  oxidoreductase  37.12 
 
 		 135 aa  92  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0541  hypothetical protein  40.37 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  25.39 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2810  TrpR binding protein WrbA  28.35 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111031 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0614  hypothetical protein  40.37 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0804749  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1333  hypothetical protein  40.37 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1538  tryptophan repressor binding protein  41.67 
 
 		 109 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  23.47 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  26.42 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  24.87 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  24.87 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  24.37 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  26.8 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2234  flavoprotein WrbA  26.17 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  28.57 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  27.32 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  23.86 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3669  TrpR binding protein WrbA  29.79 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196893 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1561  tryptophan repressor binding protein  38.89 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.789174  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0274  hypothetical protein  31.84 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.367825  normal  0.693938 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  24.35 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.38 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4089  flavoprotein WrbA  26.15 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02144  Flavodoxin/nitric oxide synthase  30.94 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0314978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1130  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.72 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0057993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  26.29 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002786  Trp repressor-binding protein  30.66 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1665  flavoprotein WrbA  30.71 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204501  hitchhiker  0.00540913 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0071  NADPH-dependent FMN reductase  34.33 
 
 		 159 aa  64.3  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109479  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  26.8 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>