76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1561 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1561  tryptophan repressor binding protein  100 
 
 
109 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.789174  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0614  hypothetical protein  97.25 
 
 
162 aa  215  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0804749  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1333  hypothetical protein  97.25 
 
 
162 aa  215  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0541  hypothetical protein  97.25 
 
 
162 aa  215  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1538  tryptophan repressor binding protein  96.33 
 
 
109 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4867  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.29 
 
 
206 aa  120  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392234  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0487  multimeric flavodoxin  56.19 
 
 
159 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  53.77 
 
 
188 aa  111  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0476  tryptophan repressor binding protein  56.31 
 
 
189 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0416  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.31 
 
 
189 aa  110  9e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.43833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4944  hypothetical protein  53.92 
 
 
203 aa  105  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1090  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 
213 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.665175  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3284  NADPH-dependent FMN reductase  51 
 
 
192 aa  98.6  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.951999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1959  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.71 
 
 
189 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1709  NADPH-dependent FMN reductase  52.94 
 
 
189 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0120762  normal  0.0625376 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0633  putative TRP repressor binding protein  52.94 
 
 
190 aa  86.7  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4769  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.34 
 
 
201 aa  81.3  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2749  flavodoxin/nitric oxide synthase  49.52 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0315  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.15 
 
 
190 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2791  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.15 
 
 
190 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3414  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.19 
 
 
190 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851071  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0022  flavodoxin domain-containing protein  47.12 
 
 
264 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3127  flavodoxin domain-containing protein  47.12 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3529  multimeric flavodoxin WrbA  47.12 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1213  tryptophan repressor binding protein  51.85 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0487623 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3792  tryptophan repressor binding protein  47.12 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0417483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3854  tryptophan repressor binding protein  47.12 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1966  flavodoxin domain-containing protein  47.12 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.952042  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3520  flavodoxin domain-containing protein  47.12 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2589  flavodoxin domain-containing protein  47.12 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2456  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.28 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3113  flavodoxin domain-containing protein  47.12 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0234  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.23 
 
 
190 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0295  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.23 
 
 
190 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000113497 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2011  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.71 
 
 
190 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0242  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.23 
 
 
190 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  hitchhiker  0.00000000952931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2405  putative TRP repressor binding protein-like protein  45.71 
 
 
190 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.570978  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0041  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.35 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3679  flavodoxin/nitric oxide synthase  40 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0287676  hitchhiker  0.00000000000590116 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2874  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.27 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00256934  hitchhiker  0.000000000000114365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22540  putative flavodoxin  41.35 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000135401  hitchhiker  0.0000186487 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1129  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.74 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2207  putative TRP repressor binding protein  40.38 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.503271 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03044  tryptophan repressor binding protein  40 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0278  flavoprotein  40 
 
 
190 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000962932 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2551  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.35 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5160  flavodoxin/nitric oxide synthase  42 
 
 
190 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.65126 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4063  hypothetical protein  39.45 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0979244  normal  0.350489 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1254  TRP repressor binding protein  38.89 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.128964  normal  0.538833 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4521  hypothetical protein  38.53 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0923053  normal  0.429536 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6542  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.1 
 
 
196 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.381266 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0554  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.5 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.519186 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6057  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.1 
 
 
196 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5693  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.1 
 
 
196 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1180  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.6 
 
 
183 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1570  NADPH-dependent FMN reductase  36.79 
 
 
213 aa  62.8  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.101574  hitchhiker  0.00239279 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2449  tryptophan repressor binding protein  38.46 
 
 
218 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3121  putative flavodoxin  38 
 
 
183 aa  61.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197452  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2899  putative flavodoxin  42.42 
 
 
184 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3582  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.62 
 
 
184 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105689  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0456  flavodoxin/nitric oxide synthase  38 
 
 
211 aa  60.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3028  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.24 
 
 
184 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2573  putative flavodoxin  37.61 
 
 
184 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.620204  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2888  tryptophan repressor-binding protein  39.45 
 
 
184 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.386778  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1421  NADPH-dependent FMN reductase  41.49 
 
 
187 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.9217  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  43.14 
 
 
186 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3424  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.63 
 
 
184 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4981  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.27 
 
 
185 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3518  multimeric flavodoxin WrbA  42.55 
 
 
189 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07059  oxidoreductase  39.45 
 
 
135 aa  57  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001005  multimeric flavodoxin WrbA  41.49 
 
 
194 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2929  putative flavodoxin  39.18 
 
 
193 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  42.86 
 
 
195 aa  52.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1522  putative flavodoxin  32.11 
 
 
184 aa  51.2  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4044  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.47 
 
 
204 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1044  tryptophan repressor binding protein  34.65 
 
 
178 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>