280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2888 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2888  tryptophan repressor-binding protein  100 
 
 		 184 aa  377  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.386778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2899  putative flavodoxin  73.37 
 
 		 184 aa  293  7e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2573  putative flavodoxin  73.77 
 
 		 184 aa  289  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.620204  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1522  putative flavodoxin  69.23 
 
 		 184 aa  276  1e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3121  putative flavodoxin  70.95 
 
 		 183 aa  273  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197452  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2929  putative flavodoxin  71.82 
 
 		 193 aa  271  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4981  flavodoxin/nitric oxide synthase  67.93 
 
 		 185 aa  271  5.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4044  flavodoxin/nitric oxide synthase  72.13 
 
 		 204 aa  266  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3028  flavodoxin/nitric oxide synthase  69.23 
 
 		 184 aa  265  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1180  flavodoxin/nitric oxide synthase  64.29 
 
 		 183 aa  246  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5160  flavodoxin/nitric oxide synthase  67.23 
 
 		 190 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.65126 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0242  flavodoxin/nitric oxide synthase  66.3 
 
 		 190 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  hitchhiker  0.00000000952931 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3582  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.54 
 
 		 184 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105689  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03044  tryptophan repressor binding protein  64.02 
 
 		 191 aa  240  7e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0234  flavodoxin/nitric oxide synthase  65.22 
 
 		 190 aa  239  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0295  flavodoxin/nitric oxide synthase  64.67 
 
 		 190 aa  238  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000113497 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3424  flavodoxin/nitric oxide synthase  62.64 
 
 		 184 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3113  flavodoxin domain-containing protein  64.71 
 
 		 237 aa  233  9e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2874  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.96 
 
 		 191 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00256934  hitchhiker  0.000000000000114365 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0554  flavodoxin/nitric oxide synthase  65.57 
 
 		 184 aa  232  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.519186 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0041  flavodoxin/nitric oxide synthase  60.44 
 
 		 184 aa  230  7.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3520  flavodoxin domain-containing protein  64.13 
 
 		 191 aa  230  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2589  flavodoxin domain-containing protein  64.13 
 
 		 191 aa  230  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3792  tryptophan repressor binding protein  64.13 
 
 		 191 aa  230  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0417483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3854  tryptophan repressor binding protein  64.13 
 
 		 191 aa  230  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0022  flavodoxin domain-containing protein  64.13 
 
 		 264 aa  230  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1966  flavodoxin domain-containing protein  64.13 
 
 		 191 aa  230  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.952042  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2791  flavodoxin/nitric oxide synthase  63.78 
 
 		 190 aa  229  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0315  flavodoxin/nitric oxide synthase  63.78 
 
 		 190 aa  229  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3529  multimeric flavodoxin WrbA  63.59 
 
 		 191 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3127  flavodoxin domain-containing protein  63.59 
 
 		 191 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3414  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.41 
 
 		 190 aa  226  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2456  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.34 
 
 		 184 aa  226  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0278  flavoprotein  64.71 
 
 		 190 aa  225  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000962932 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2551  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.92 
 
 		 184 aa  224  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6542  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.67 
 
 		 196 aa  224  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2449  tryptophan repressor binding protein  58.73 
 
 		 218 aa  223  9e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0456  flavodoxin/nitric oxide synthase  63.48 
 
 		 211 aa  223  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5693  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.67 
 
 		 196 aa  223  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6057  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.67 
 
 		 196 aa  223  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2405  putative TRP repressor binding protein-like protein  58.6 
 
 		 190 aa  221  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.570978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4063  hypothetical protein  61.88 
 
 		 196 aa  220  9e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0979244  normal  0.350489 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2011  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.98 
 
 		 190 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4521  hypothetical protein  61.88 
 
 		 196 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0923053  normal  0.429536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3679  flavodoxin/nitric oxide synthase  62.57 
 
 		 190 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0287676  hitchhiker  0.00000000000590116 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2207  putative TRP repressor binding protein  56.91 
 
 		 190 aa  214  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.503271 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22540  putative flavodoxin  54.64 
 
 		 184 aa  207  9e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000135401  hitchhiker  0.0000186487 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  49.47 
 
 		 188 aa  168  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1090  NADPH-dependent FMN reductase  49.2 
 
 		 213 aa  157  6e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.665175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1709  NADPH-dependent FMN reductase  49.21 
 
 		 189 aa  157  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0120762  normal  0.0625376 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1959  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.55 
 
 		 189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3284  NADPH-dependent FMN reductase  47.87 
 
 		 192 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.951999 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4769  flavodoxin/nitric oxide synthase  48.95 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4944  hypothetical protein  44.68 
 
 		 203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4867  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.32 
 
 		 206 aa  144  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392234  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0633  putative TRP repressor binding protein  43.78 
 
 		 190 aa  141  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0416  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.92 
 
 		 189 aa  141  4e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.43833  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0476  tryptophan repressor binding protein  43.39 
 
 		 189 aa  140  9e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2749  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.32 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  41.49 
 
 		 186 aa  130  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1254  TRP repressor binding protein  39.66 
 
 		 200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.128964  normal  0.538833 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  41.27 
 
 		 195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1570  NADPH-dependent FMN reductase  39.46 
 
 		 213 aa  123  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.101574  hitchhiker  0.00239279 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1421  NADPH-dependent FMN reductase  38.97 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.9217  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1129  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.93 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001005  multimeric flavodoxin WrbA  39.2 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0487  multimeric flavodoxin  50 
 
 		 159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3518  multimeric flavodoxin WrbA  38.46 
 
 		 189 aa  114  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07059  oxidoreductase  45.32 
 
 		 135 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1044  tryptophan repressor binding protein  40.78 
 
 		 178 aa  99.8  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1213  tryptophan repressor binding protein  41.4 
 
 		 205 aa  97.8  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0487623 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  34.62 
 
 		 203 aa  84.3  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  31.25 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  31.88 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  31.75 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  31.88 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  31.88 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  31.53 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  29.81 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  31.53 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  30 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  30.29 
 
 		 199 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  31.13 
 
 		 203 aa  72  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.81 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  27.09 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  26.6 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1973  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.85 
 
 		 205 aa  67  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0541  hypothetical protein  40.91 
 
 		 162 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1050  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.33 
 
 		 202 aa  67  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  29.35 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1333  hypothetical protein  40.91 
 
 		 162 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0614  hypothetical protein  40.91 
 
 		 162 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0804749  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3183  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.48 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.202353  decreased coverage  0.0000326844 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3216  flavoprotein WrbA  30.69 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103808 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  27.09 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2340  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.36 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200739 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3669  TrpR binding protein WrbA  29.7 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196893 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2181  TrpR binding protein WrbA  29.56 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  27.88 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  27.23 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>