292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0633 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0633  putative TRP repressor binding protein  100 
 
 		 190 aa  390  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2749  flavodoxin/nitric oxide synthase  72.83 
 
 		 184 aa  286  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0476  tryptophan repressor binding protein  65.05 
 
 		 189 aa  256  2e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0416  flavodoxin/nitric oxide synthase  65.05 
 
 		 189 aa  254  4e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.43833  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  52.17 
 
 		 188 aa  198  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1959  flavodoxin/nitric oxide synthase  49.19 
 
 		 189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3284  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 		 192 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.951999 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2207  putative TRP repressor binding protein  53.51 
 
 		 190 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.503271 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4867  flavodoxin/nitric oxide synthase  50.8 
 
 		 206 aa  177  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392234  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4944  hypothetical protein  50.53 
 
 		 203 aa  176  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2405  putative TRP repressor binding protein-like protein  51.63 
 
 		 190 aa  174  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.570978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2011  flavodoxin/nitric oxide synthase  51.09 
 
 		 190 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2791  flavodoxin/nitric oxide synthase  48.68 
 
 		 190 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0315  flavodoxin/nitric oxide synthase  48.68 
 
 		 190 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3529  multimeric flavodoxin WrbA  49.46 
 
 		 191 aa  167  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3127  flavodoxin domain-containing protein  49.46 
 
 		 191 aa  167  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3792  tryptophan repressor binding protein  49.46 
 
 		 191 aa  167  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0417483  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2589  flavodoxin domain-containing protein  49.46 
 
 		 191 aa  167  7e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1966  flavodoxin domain-containing protein  49.46 
 
 		 191 aa  167  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.952042  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3520  flavodoxin domain-containing protein  49.46 
 
 		 191 aa  167  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3854  tryptophan repressor binding protein  49.46 
 
 		 191 aa  167  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0022  flavodoxin domain-containing protein  50.28 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3113  flavodoxin domain-containing protein  50.84 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0234  flavodoxin/nitric oxide synthase  48.66 
 
 		 190 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0295  flavodoxin/nitric oxide synthase  48.13 
 
 		 190 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000113497 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3414  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.06 
 
 		 190 aa  164  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0242  flavodoxin/nitric oxide synthase  48.89 
 
 		 190 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  hitchhiker  0.00000000952931 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0041  flavodoxin/nitric oxide synthase  48.4 
 
 		 184 aa  162  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2874  flavodoxin/nitric oxide synthase  48.92 
 
 		 191 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00256934  hitchhiker  0.000000000000114365 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1090  NADPH-dependent FMN reductase  45.05 
 
 		 213 aa  161  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.665175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1254  TRP repressor binding protein  46.33 
 
 		 200 aa  152  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.128964  normal  0.538833 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3679  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.87 
 
 		 190 aa  150  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0287676  hitchhiker  0.00000000000590116 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2449  tryptophan repressor binding protein  43.68 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1709  NADPH-dependent FMN reductase  48.31 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0120762  normal  0.0625376 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3028  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.09 
 
 		 184 aa  147  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0278  flavoprotein  48.94 
 
 		 190 aa  148  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000962932 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1129  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.86 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1570  NADPH-dependent FMN reductase  43.33 
 
 		 213 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.101574  hitchhiker  0.00239279 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4981  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.56 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3582  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.08 
 
 		 184 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105689  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03044  tryptophan repressor binding protein  43.85 
 
 		 191 aa  145  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4769  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.16 
 
 		 201 aa  145  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0487  multimeric flavodoxin  53.02 
 
 		 159 aa  145  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2551  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.09 
 
 		 184 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2899  putative flavodoxin  44.02 
 
 		 184 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3121  putative flavodoxin  41.62 
 
 		 183 aa  142  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197452  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2573  putative flavodoxin  45.79 
 
 		 184 aa  142  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.620204  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2888  tryptophan repressor-binding protein  43.78 
 
 		 184 aa  141  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.386778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2456  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.94 
 
 		 184 aa  140  9e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5160  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.75 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.65126 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1522  putative flavodoxin  44.15 
 
 		 184 aa  137  8.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4521  hypothetical protein  46.52 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0923053  normal  0.429536 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5693  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.74 
 
 		 196 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4063  hypothetical protein  47.34 
 
 		 196 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0979244  normal  0.350489 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6057  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.74 
 
 		 196 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6542  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.31 
 
 		 196 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381266 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1213  tryptophan repressor binding protein  47.62 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0487623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0456  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.05 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1180  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.9 
 
 		 183 aa  128  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3424  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.8 
 
 		 184 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  41.57 
 
 		 186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1421  NADPH-dependent FMN reductase  39.27 
 
 		 187 aa  124  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.9217  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  40.41 
 
 		 195 aa  124  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3518  multimeric flavodoxin WrbA  38.3 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4044  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.88 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2929  putative flavodoxin  42.02 
 
 		 193 aa  120  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001005  multimeric flavodoxin WrbA  40 
 
 		 194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22540  putative flavodoxin  39.25 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000135401  hitchhiker  0.0000186487 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07059  oxidoreductase  46.32 
 
 		 135 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1044  tryptophan repressor binding protein  39.23 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0554  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.55 
 
 		 184 aa  112  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.519186 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  35.29 
 
 		 203 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1333  hypothetical protein  52.83 
 
 		 162 aa  92.8  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0541  hypothetical protein  52.83 
 
 		 162 aa  92.8  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0614  hypothetical protein  52.83 
 
 		 162 aa  92.8  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0804749  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  33 
 
 		 203 aa  89.4  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  33.17 
 
 		 203 aa  88.6  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  31.37 
 
 		 204 aa  88.6  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2234  flavoprotein WrbA  31.53 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1561  tryptophan repressor binding protein  52.94 
 
 		 109 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.789174  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  33.16 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  28.5 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1538  tryptophan repressor binding protein  50.98 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  29.5 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  29.5 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  29 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  31.82 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  32.64 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  31.63 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  31.82 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  28.64 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  30.15 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  28.64 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1914  TrpR binding protein WrbA  29.67 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.936643 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1014  TrpR binding protein WrbA  33.85 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2136  TrpR binding protein WrbA  32.34 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  28.92 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2568  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.34 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1049  TrpR binding protein WrbA  33.33 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  31.16 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>