283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3679 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3679  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 
190 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0287676  hitchhiker  0.00000000000590116 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0278  flavoprotein  93.16 
 
 
190 aa  338  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000962932 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2874  flavodoxin/nitric oxide synthase  83.51 
 
 
191 aa  330  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00256934  hitchhiker  0.000000000000114365 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0295  flavodoxin/nitric oxide synthase  78.95 
 
 
190 aa  316  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000113497 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3113  flavodoxin domain-containing protein  79.26 
 
 
237 aa  313  7e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0234  flavodoxin/nitric oxide synthase  78.42 
 
 
190 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0242  flavodoxin/nitric oxide synthase  78.42 
 
 
190 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  hitchhiker  0.00000000952931 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0022  flavodoxin domain-containing protein  78.72 
 
 
264 aa  310  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2589  flavodoxin domain-containing protein  78.72 
 
 
191 aa  309  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3854  tryptophan repressor binding protein  78.72 
 
 
191 aa  309  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1966  flavodoxin domain-containing protein  78.72 
 
 
191 aa  309  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.952042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3792  tryptophan repressor binding protein  78.72 
 
 
191 aa  309  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0417483  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3520  flavodoxin domain-containing protein  78.72 
 
 
191 aa  309  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3529  multimeric flavodoxin WrbA  78.19 
 
 
191 aa  307  5e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3127  flavodoxin domain-containing protein  78.19 
 
 
191 aa  307  5e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2791  flavodoxin/nitric oxide synthase  75.79 
 
 
190 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0315  flavodoxin/nitric oxide synthase  75.79 
 
 
190 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3414  flavodoxin/nitric oxide synthase  75 
 
 
190 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851071  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2207  putative TRP repressor binding protein  67.55 
 
 
190 aa  274  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.503271 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2405  putative TRP repressor binding protein-like protein  65.79 
 
 
190 aa  270  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.570978  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2011  flavodoxin/nitric oxide synthase  65.79 
 
 
190 aa  269  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2888  tryptophan repressor-binding protein  62.57 
 
 
184 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.386778  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2573  putative flavodoxin  60 
 
 
184 aa  228  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.620204  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03044  tryptophan repressor binding protein  61.5 
 
 
191 aa  226  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1522  putative flavodoxin  57.22 
 
 
184 aa  219  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3121  putative flavodoxin  59.24 
 
 
183 aa  218  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197452  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2449  tryptophan repressor binding protein  55.85 
 
 
218 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4044  flavodoxin/nitric oxide synthase  58.29 
 
 
204 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3028  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.52 
 
 
184 aa  206  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4981  flavodoxin/nitric oxide synthase  53.48 
 
 
185 aa  205  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2899  putative flavodoxin  55.85 
 
 
184 aa  204  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3582  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.55 
 
 
184 aa  204  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105689  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0041  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.32 
 
 
184 aa  203  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0554  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.61 
 
 
184 aa  202  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.519186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1180  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.01 
 
 
183 aa  201  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5160  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.14 
 
 
190 aa  200  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.65126 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2456  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.15 
 
 
184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6542  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.56 
 
 
196 aa  197  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.381266 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2551  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.61 
 
 
184 aa  197  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4521  hypothetical protein  55.79 
 
 
196 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0923053  normal  0.429536 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3424  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.01 
 
 
184 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5693  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.56 
 
 
196 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6057  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.56 
 
 
196 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4063  hypothetical protein  55.03 
 
 
196 aa  192  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0979244  normal  0.350489 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2929  putative flavodoxin  55.14 
 
 
193 aa  191  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3284  NADPH-dependent FMN reductase  52.88 
 
 
192 aa  185  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.951999 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0456  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.61 
 
 
211 aa  183  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1090  NADPH-dependent FMN reductase  46.84 
 
 
213 aa  179  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.665175  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  47.57 
 
 
188 aa  175  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0416  flavodoxin/nitric oxide synthase  49.2 
 
 
189 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.43833  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0476  tryptophan repressor binding protein  48.66 
 
 
189 aa  171  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22540  putative flavodoxin  48.62 
 
 
184 aa  168  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000135401  hitchhiker  0.0000186487 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1959  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.21 
 
 
189 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0633  putative TRP repressor binding protein  47.87 
 
 
190 aa  164  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4769  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.97 
 
 
201 aa  162  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1709  NADPH-dependent FMN reductase  47.87 
 
 
189 aa  158  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0120762  normal  0.0625376 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4867  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.64 
 
 
206 aa  157  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392234  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4944  hypothetical protein  45.5 
 
 
203 aa  149  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1254  TRP repressor binding protein  41.53 
 
 
200 aa  144  6e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.128964  normal  0.538833 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1570  NADPH-dependent FMN reductase  40.98 
 
 
213 aa  142  4e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.101574  hitchhiker  0.00239279 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2749  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.01 
 
 
184 aa  141  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1129  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.78 
 
 
205 aa  141  5e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0487  multimeric flavodoxin  50.35 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  41.49 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1421  NADPH-dependent FMN reductase  40.61 
 
 
187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.9217  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  39.47 
 
 
186 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1213  tryptophan repressor binding protein  43.33 
 
 
205 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0487623 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001005  multimeric flavodoxin WrbA  37.37 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3518  multimeric flavodoxin WrbA  38.95 
 
 
189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07059  oxidoreductase  44.53 
 
 
135 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1044  tryptophan repressor binding protein  38.8 
 
 
178 aa  107  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  30.69 
 
 
199 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  32.68 
 
 
203 aa  91.7  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  33.97 
 
 
204 aa  91.3  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  30.2 
 
 
200 aa  89  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  29.85 
 
 
199 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  29.85 
 
 
199 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  29.85 
 
 
199 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  31.9 
 
 
203 aa  87  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.56 
 
 
160 aa  84.7  7e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  29.27 
 
 
200 aa  84  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4564  TrpR binding protein WrbA  29.47 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  30.73 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  28.22 
 
 
199 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  29.95 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  29.76 
 
 
200 aa  81.3  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2181  TrpR binding protein WrbA  30.39 
 
 
199 aa  81.3  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  29.76 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  32.68 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  29.7 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1333  hypothetical protein  41.51 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0614  hypothetical protein  41.51 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0804749  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0541  hypothetical protein  41.51 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  28.78 
 
 
200 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  29.47 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3216  flavoprotein WrbA  29.41 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103808 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2234  flavoprotein WrbA  29.47 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  28.29 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  28.5 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  28.29 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>