273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3121 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3121  putative flavodoxin  100 
 
 		 183 aa  373  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197452  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2899  putative flavodoxin  72.63 
 
 		 184 aa  277  7e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2888  tryptophan repressor-binding protein  70.95 
 
 		 184 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.386778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3028  flavodoxin/nitric oxide synthase  69.44 
 
 		 184 aa  265  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2573  putative flavodoxin  68.72 
 
 		 184 aa  262  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.620204  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4981  flavodoxin/nitric oxide synthase  65.57 
 
 		 185 aa  257  8e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2929  putative flavodoxin  71.02 
 
 		 193 aa  249  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4044  flavodoxin/nitric oxide synthase  68.72 
 
 		 204 aa  248  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3582  flavodoxin/nitric oxide synthase  64.25 
 
 		 184 aa  245  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105689  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1522  putative flavodoxin  62.78 
 
 		 184 aa  244  4e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0041  flavodoxin/nitric oxide synthase  62.78 
 
 		 184 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5160  flavodoxin/nitric oxide synthase  62.22 
 
 		 190 aa  234  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.65126 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1180  flavodoxin/nitric oxide synthase  60.89 
 
 		 183 aa  233  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3424  flavodoxin/nitric oxide synthase  63.69 
 
 		 184 aa  228  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0295  flavodoxin/nitric oxide synthase  62.09 
 
 		 190 aa  228  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000113497 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0554  flavodoxin/nitric oxide synthase  65.76 
 
 		 184 aa  228  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.519186 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6542  flavodoxin/nitric oxide synthase  64.94 
 
 		 196 aa  227  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381266 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5693  flavodoxin/nitric oxide synthase  64.94 
 
 		 196 aa  226  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6057  flavodoxin/nitric oxide synthase  64.94 
 
 		 196 aa  226  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0242  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.08 
 
 		 190 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  hitchhiker  0.00000000952931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0234  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.54 
 
 		 190 aa  225  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2551  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.67 
 
 		 184 aa  224  5.0000000000000005e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2874  flavodoxin/nitric oxide synthase  60.87 
 
 		 191 aa  224  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00256934  hitchhiker  0.000000000000114365 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2456  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.61 
 
 		 184 aa  223  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3113  flavodoxin domain-containing protein  60.11 
 
 		 237 aa  222  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4063  hypothetical protein  63.43 
 
 		 196 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0979244  normal  0.350489 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0022  flavodoxin domain-containing protein  60.11 
 
 		 264 aa  221  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4521  hypothetical protein  62.86 
 
 		 196 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0923053  normal  0.429536 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3127  flavodoxin domain-containing protein  60.11 
 
 		 191 aa  220  8e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3529  multimeric flavodoxin WrbA  60.11 
 
 		 191 aa  220  8e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3854  tryptophan repressor binding protein  60.11 
 
 		 191 aa  220  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2589  flavodoxin domain-containing protein  60.11 
 
 		 191 aa  220  9e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3792  tryptophan repressor binding protein  60.11 
 
 		 191 aa  220  9e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0417483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1966  flavodoxin domain-containing protein  60.11 
 
 		 191 aa  220  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.952042  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3520  flavodoxin domain-containing protein  60.11 
 
 		 191 aa  220  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2791  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.34 
 
 		 190 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0315  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.34 
 
 		 190 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2207  putative TRP repressor binding protein  59.14 
 
 		 190 aa  218  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.503271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3414  flavodoxin/nitric oxide synthase  58.79 
 
 		 190 aa  218  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0456  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.24 
 
 		 211 aa  216  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2405  putative TRP repressor binding protein-like protein  56.52 
 
 		 190 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.570978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2011  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.52 
 
 		 190 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03044  tryptophan repressor binding protein  57.07 
 
 		 191 aa  211  5.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0278  flavoprotein  62.5 
 
 		 190 aa  210  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000962932 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2449  tryptophan repressor binding protein  53.51 
 
 		 218 aa  204  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3679  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.24 
 
 		 190 aa  202  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0287676  hitchhiker  0.00000000000590116 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22540  putative flavodoxin  51.11 
 
 		 184 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000135401  hitchhiker  0.0000186487 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  46.56 
 
 		 188 aa  160  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1090  NADPH-dependent FMN reductase  45.45 
 
 		 213 aa  148  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.665175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1959  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.19 
 
 		 189 aa  145  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1709  NADPH-dependent FMN reductase  44.15 
 
 		 189 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0120762  normal  0.0625376 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0476  tryptophan repressor binding protein  43.01 
 
 		 189 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0416  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.01 
 
 		 189 aa  143  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.43833  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0633  putative TRP repressor binding protein  41.62 
 
 		 190 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4944  hypothetical protein  43.32 
 
 		 203 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3284  NADPH-dependent FMN reductase  41.18 
 
 		 192 aa  138  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.951999 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4769  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.55 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4867  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.09 
 
 		 206 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392234  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1254  TRP repressor binding protein  39.33 
 
 		 200 aa  127  6e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.128964  normal  0.538833 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  38.95 
 
 		 195 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  42.39 
 
 		 186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2749  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.11 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1129  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.33 
 
 		 205 aa  121  6e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1570  NADPH-dependent FMN reductase  36.65 
 
 		 213 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.101574  hitchhiker  0.00239279 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1421  NADPH-dependent FMN reductase  37.7 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.9217  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001005  multimeric flavodoxin WrbA  38.66 
 
 		 194 aa  115  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07059  oxidoreductase  43.28 
 
 		 135 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3518  multimeric flavodoxin WrbA  34.55 
 
 		 189 aa  110  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0487  multimeric flavodoxin  43.38 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1044  tryptophan repressor binding protein  35.71 
 
 		 178 aa  95.1  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1213  tryptophan repressor binding protein  39.56 
 
 		 205 aa  91.7  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0487623 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  29.59 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.4 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  31.37 
 
 		 203 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  27.4 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  28.37 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  28.08 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  30.77 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0614  hypothetical protein  39.6 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0804749  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0541  hypothetical protein  39.6 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  28.87 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1333  hypothetical protein  39.6 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  31.03 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  27.23 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  28.71 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2234  flavoprotein WrbA  26.73 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  28.71 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1516  TrpR binding protein WrbA  31.47 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.348571 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1973  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.73 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1050  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.99 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  31.69 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  27.23 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2126  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.73 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4096  TrpR binding protein WrbA  28.86 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.832118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  28.87 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  25.63 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  28.87 
 
 		 200 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  27.5 
 
 		 200 aa  64.3  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  27.5 
 
 		 200 aa  64.3  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2591  TrpR binding protein WrbA  30.07 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.172537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>