233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4521 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4521  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  400  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0923053  normal  0.429536 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4063  hypothetical protein  97.96 
 
 		 196 aa  370  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0979244  normal  0.350489 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5693  flavodoxin/nitric oxide synthase  82.99 
 
 		 196 aa  316  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6057  flavodoxin/nitric oxide synthase  82.99 
 
 		 196 aa  316  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6542  flavodoxin/nitric oxide synthase  81.96 
 
 		 196 aa  313  9e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381266 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5160  flavodoxin/nitric oxide synthase  71.58 
 
 		 190 aa  276  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.65126 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0456  flavodoxin/nitric oxide synthase  73.94 
 
 		 211 aa  276  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1180  flavodoxin/nitric oxide synthase  63.33 
 
 		 183 aa  240  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3028  flavodoxin/nitric oxide synthase  63.54 
 
 		 184 aa  240  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3582  flavodoxin/nitric oxide synthase  62.22 
 
 		 184 aa  238  5.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105689  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2899  putative flavodoxin  61.88 
 
 		 184 aa  236  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3121  putative flavodoxin  62.86 
 
 		 183 aa  236  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197452  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2888  tryptophan repressor-binding protein  61.88 
 
 		 184 aa  236  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.386778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3424  flavodoxin/nitric oxide synthase  65 
 
 		 184 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1522  putative flavodoxin  60.44 
 
 		 184 aa  231  4.0000000000000004e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4981  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.33 
 
 		 185 aa  229  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2573  putative flavodoxin  60.99 
 
 		 184 aa  228  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.620204  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2929  putative flavodoxin  63.48 
 
 		 193 aa  226  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4044  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.67 
 
 		 204 aa  221  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0041  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.87 
 
 		 184 aa  216  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2456  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.7 
 
 		 184 aa  211  7e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0554  flavodoxin/nitric oxide synthase  58.56 
 
 		 184 aa  206  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.519186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2551  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.25 
 
 		 184 aa  205  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3127  flavodoxin domain-containing protein  55.26 
 
 		 191 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3529  multimeric flavodoxin WrbA  55.26 
 
 		 191 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2589  flavodoxin domain-containing protein  55.26 
 
 		 191 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2874  flavodoxin/nitric oxide synthase  53.68 
 
 		 191 aa  201  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00256934  hitchhiker  0.000000000000114365 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3113  flavodoxin domain-containing protein  56.15 
 
 		 237 aa  201  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1966  flavodoxin domain-containing protein  55.26 
 
 		 191 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.952042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3792  tryptophan repressor binding protein  55.26 
 
 		 191 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0417483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3854  tryptophan repressor binding protein  55.26 
 
 		 191 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3520  flavodoxin domain-containing protein  55.26 
 
 		 191 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0022  flavodoxin domain-containing protein  55.26 
 
 		 264 aa  201  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0242  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.08 
 
 		 190 aa  201  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  hitchhiker  0.00000000952931 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3414  flavodoxin/nitric oxide synthase  53.51 
 
 		 190 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0295  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.01 
 
 		 190 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000113497 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2791  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.14 
 
 		 190 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0315  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.14 
 
 		 190 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22540  putative flavodoxin  56.59 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000135401  hitchhiker  0.0000186487 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0234  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.01 
 
 		 190 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2207  putative TRP repressor binding protein  52.63 
 
 		 190 aa  195  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.503271 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2405  putative TRP repressor binding protein-like protein  52.66 
 
 		 190 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.570978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2011  flavodoxin/nitric oxide synthase  52.66 
 
 		 190 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03044  tryptophan repressor binding protein  52.91 
 
 		 191 aa  192  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0278  flavoprotein  56.38 
 
 		 190 aa  190  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000962932 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3679  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.56 
 
 		 190 aa  188  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0287676  hitchhiker  0.00000000000590116 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2449  tryptophan repressor binding protein  48.22 
 
 		 218 aa  184  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 		 188 aa  174  8e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4867  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.21 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392234  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4944  hypothetical protein  46.52 
 
 		 203 aa  155  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1959  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.97 
 
 		 189 aa  154  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1090  NADPH-dependent FMN reductase  45.79 
 
 		 213 aa  153  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.665175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0416  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.52 
 
 		 189 aa  150  8e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.43833  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0476  tryptophan repressor binding protein  45.99 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0633  putative TRP repressor binding protein  48.13 
 
 		 190 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3284  NADPH-dependent FMN reductase  45.08 
 
 		 192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.951999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2749  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.09 
 
 		 184 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4769  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.31 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1709  NADPH-dependent FMN reductase  45.41 
 
 		 189 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0120762  normal  0.0625376 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0487  multimeric flavodoxin  48.25 
 
 		 159 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1421  NADPH-dependent FMN reductase  39.69 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.9217  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1213  tryptophan repressor binding protein  45.13 
 
 		 205 aa  124  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0487623 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1129  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.22 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1254  TRP repressor binding protein  36.22 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.128964  normal  0.538833 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1570  NADPH-dependent FMN reductase  36.65 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.101574  hitchhiker  0.00239279 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  38.42 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  39.27 
 
 		 195 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001005  multimeric flavodoxin WrbA  41.26 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07059  oxidoreductase  42.03 
 
 		 135 aa  105  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1044  tryptophan repressor binding protein  39.44 
 
 		 178 aa  101  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3518  multimeric flavodoxin WrbA  32.81 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  31.88 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.97 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1333  hypothetical protein  40 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0541  hypothetical protein  40 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0614  hypothetical protein  40 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0804749  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  31.4 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  32.52 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  33.83 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4564  TrpR binding protein WrbA  31.07 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  32.67 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  28.57 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5355  flavoprotein WrbA  28.44 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272087  normal  0.149509 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  31.79 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  30.05 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  30.2 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  30.05 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  30.2 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  30.69 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  29.13 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1561  tryptophan repressor binding protein  38.53 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.789174  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  29.61 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  30 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  31.43 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  29.33 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  36.64 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  29.21 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1242  TrpR binding protein WrbA  29.85 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  29.61 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1229  TrpR binding protein WrbA  30.85 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.570385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>