275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4769 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4769  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 
201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3284  NADPH-dependent FMN reductase  49.23 
 
 
192 aa  171  6.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.951999 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2405  putative TRP repressor binding protein-like protein  48.72 
 
 
190 aa  167  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.570978  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0234  flavodoxin/nitric oxide synthase  50.75 
 
 
190 aa  167  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0242  flavodoxin/nitric oxide synthase  50.75 
 
 
190 aa  167  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  hitchhiker  0.00000000952931 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2011  flavodoxin/nitric oxide synthase  48.21 
 
 
190 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2207  putative TRP repressor binding protein  48.72 
 
 
190 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.503271 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0295  flavodoxin/nitric oxide synthase  49.75 
 
 
190 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000113497 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3529  multimeric flavodoxin WrbA  50.26 
 
 
191 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3127  flavodoxin domain-containing protein  50.26 
 
 
191 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3520  flavodoxin domain-containing protein  50.26 
 
 
191 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2589  flavodoxin domain-containing protein  50.26 
 
 
191 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1966  flavodoxin domain-containing protein  50.26 
 
 
191 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.952042  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3854  tryptophan repressor binding protein  50.26 
 
 
191 aa  162  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3792  tryptophan repressor binding protein  50.26 
 
 
191 aa  162  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0417483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0022  flavodoxin domain-containing protein  50.26 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1090  NADPH-dependent FMN reductase  47.52 
 
 
213 aa  161  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.665175  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4867  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.96 
 
 
206 aa  160  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392234  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1959  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.91 
 
 
189 aa  160  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3113  flavodoxin domain-containing protein  49.74 
 
 
237 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2791  flavodoxin/nitric oxide synthase  49.24 
 
 
190 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0315  flavodoxin/nitric oxide synthase  49.24 
 
 
190 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3414  flavodoxin/nitric oxide synthase  49.74 
 
 
190 aa  158  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851071  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2874  flavodoxin/nitric oxide synthase  46 
 
 
191 aa  158  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00256934  hitchhiker  0.000000000000114365 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3679  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.97 
 
 
190 aa  156  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0287676  hitchhiker  0.00000000000590116 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0278  flavoprotein  45.64 
 
 
190 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000962932 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2456  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.74 
 
 
184 aa  155  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1709  NADPH-dependent FMN reductase  46.32 
 
 
189 aa  154  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0120762  normal  0.0625376 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0416  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.74 
 
 
189 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.43833  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0041  flavodoxin/nitric oxide synthase  48.4 
 
 
184 aa  153  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0476  tryptophan repressor binding protein  45.21 
 
 
189 aa  152  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03044  tryptophan repressor binding protein  46.35 
 
 
191 aa  151  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  45.95 
 
 
188 aa  150  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2449  tryptophan repressor binding protein  46.32 
 
 
218 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4944  hypothetical protein  46.39 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2888  tryptophan repressor-binding protein  48.95 
 
 
184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.386778  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0456  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.06 
 
 
211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0633  putative TRP repressor binding protein  45.16 
 
 
190 aa  145  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2899  putative flavodoxin  46.63 
 
 
184 aa  145  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2551  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.62 
 
 
184 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4981  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.09 
 
 
185 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5160  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.25 
 
 
190 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.65126 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4044  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.81 
 
 
204 aa  142  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1522  putative flavodoxin  45.7 
 
 
184 aa  142  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0487  multimeric flavodoxin  52.11 
 
 
159 aa  141  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3582  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.55 
 
 
184 aa  140  9e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105689  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2573  putative flavodoxin  42.63 
 
 
184 aa  139  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.620204  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3028  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.68 
 
 
184 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3121  putative flavodoxin  43.55 
 
 
183 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197452  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1180  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.09 
 
 
183 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4063  hypothetical protein  44.62 
 
 
196 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0979244  normal  0.350489 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5693  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.09 
 
 
196 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6057  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.09 
 
 
196 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4521  hypothetical protein  43.75 
 
 
196 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0923053  normal  0.429536 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2749  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.86 
 
 
184 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6542  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.55 
 
 
196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.381266 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1570  NADPH-dependent FMN reductase  37.37 
 
 
213 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.101574  hitchhiker  0.00239279 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22540  putative flavodoxin  41.84 
 
 
184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000135401  hitchhiker  0.0000186487 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2929  putative flavodoxin  43.46 
 
 
193 aa  125  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3518  multimeric flavodoxin WrbA  42.49 
 
 
189 aa  123  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3424  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.43 
 
 
184 aa  122  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1129  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.14 
 
 
205 aa  121  9e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1254  TRP repressor binding protein  36.92 
 
 
200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.128964  normal  0.538833 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1421  NADPH-dependent FMN reductase  39.2 
 
 
187 aa  119  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.9217  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0554  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.43 
 
 
184 aa  118  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.519186 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  40.43 
 
 
186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  42.33 
 
 
195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1044  tryptophan repressor binding protein  41.71 
 
 
178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1213  tryptophan repressor binding protein  42.86 
 
 
205 aa  105  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0487623 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001005  multimeric flavodoxin WrbA  35.05 
 
 
194 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07059  oxidoreductase  38.52 
 
 
135 aa  92  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0614  hypothetical protein  44.86 
 
 
162 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0804749  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0541  hypothetical protein  44.86 
 
 
162 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1333  hypothetical protein  44.86 
 
 
162 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1561  tryptophan repressor binding protein  44.34 
 
 
109 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.789174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1538  tryptophan repressor binding protein  43.4 
 
 
109 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  31.25 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  31.25 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  29.76 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  30.63 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  30.63 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  34.27 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  28.29 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  27.8 
 
 
200 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01007  TrpR binding protein WrbA  33.1 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2638  flavoprotein WrbA  33.1 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.836437  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2591  TrpR binding protein WrbA  33.1 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.172537 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01014  hypothetical protein  33.1 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1122  TrpR binding protein WrbA  33.1 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98388  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1117  TrpR binding protein WrbA  33.1 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2120  TrpR binding protein WrbA  33.1 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  27.44 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0558  flavoprotein WrbA  29.7 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.731292  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1813  TrpR binding protein WrbA  30.67 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000250234  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2340  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.75 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0200739 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  29.77 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0608  TrpR binding protein WrbA  32.89 
 
 
198 aa  69.3  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  30.99 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002786  Trp repressor-binding protein  27.04 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1242  TrpR binding protein WrbA  32.41 
 
 
198 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>