76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1538 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1538  tryptophan repressor binding protein  100 
 
 
109 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1561  tryptophan repressor binding protein  96.33 
 
 
109 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.789174  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1333  hypothetical protein  95.41 
 
 
162 aa  209  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0541  hypothetical protein  95.41 
 
 
162 aa  209  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0614  hypothetical protein  95.41 
 
 
162 aa  209  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0804749  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4867  flavodoxin/nitric oxide synthase  53.33 
 
 
206 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392234  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0487  multimeric flavodoxin  54.29 
 
 
159 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0476  tryptophan repressor binding protein  54.37 
 
 
189 aa  107  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  52.88 
 
 
188 aa  106  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0416  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.37 
 
 
189 aa  105  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.43833  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1090  NADPH-dependent FMN reductase  49.06 
 
 
213 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.665175  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4944  hypothetical protein  52.94 
 
 
203 aa  101  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3284  NADPH-dependent FMN reductase  49 
 
 
192 aa  94.4  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.951999 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1709  NADPH-dependent FMN reductase  51.96 
 
 
189 aa  93.6  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0120762  normal  0.0625376 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1959  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.87 
 
 
189 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0633  putative TRP repressor binding protein  50.98 
 
 
190 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4769  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.4 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2456  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.2 
 
 
184 aa  77.4  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1213  tryptophan repressor binding protein  50.62 
 
 
205 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0487623 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1129  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.52 
 
 
205 aa  73.9  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2749  flavodoxin/nitric oxide synthase  50 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2791  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.23 
 
 
190 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0315  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.23 
 
 
190 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0022  flavodoxin domain-containing protein  45.19 
 
 
264 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3414  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.27 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851071  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3854  tryptophan repressor binding protein  45.19 
 
 
191 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3792  tryptophan repressor binding protein  45.19 
 
 
191 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0417483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1966  flavodoxin domain-containing protein  45.19 
 
 
191 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.952042  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3520  flavodoxin domain-containing protein  45.19 
 
 
191 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3529  multimeric flavodoxin WrbA  45.19 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3127  flavodoxin domain-containing protein  45.19 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2589  flavodoxin domain-containing protein  45.19 
 
 
191 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3113  flavodoxin domain-containing protein  45.19 
 
 
237 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1254  TRP repressor binding protein  41.67 
 
 
200 aa  70.5  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.128964  normal  0.538833 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0242  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.31 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  hitchhiker  0.00000000952931 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0295  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.31 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000113497 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0234  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.31 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2011  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.44 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2405  putative TRP repressor binding protein-like protein  44.44 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.570978  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0041  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.38 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03044  tryptophan repressor binding protein  39.05 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22540  putative flavodoxin  39.42 
 
 
184 aa  66.6  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000135401  hitchhiker  0.0000186487 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2551  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.35 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3679  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.1 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0287676  hitchhiker  0.00000000000590116 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5160  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.67 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.65126 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0554  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.54 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.519186 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2874  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.35 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00256934  hitchhiker  0.000000000000114365 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1180  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.6 
 
 
183 aa  63.5  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1570  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
213 aa  62.8  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.101574  hitchhiker  0.00239279 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0278  flavoprotein  38.1 
 
 
190 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000962932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2207  putative TRP repressor binding protein  39.25 
 
 
190 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.503271 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6542  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.96 
 
 
196 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.381266 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4063  hypothetical protein  37.61 
 
 
196 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0979244  normal  0.350489 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5693  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.96 
 
 
196 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6057  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.96 
 
 
196 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4521  hypothetical protein  36.7 
 
 
196 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0923053  normal  0.429536 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2449  tryptophan repressor binding protein  37.5 
 
 
218 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2899  putative flavodoxin  41.41 
 
 
184 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0456  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.96 
 
 
211 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2888  tryptophan repressor-binding protein  39.05 
 
 
184 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.386778  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3582  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.63 
 
 
184 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105689  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3028  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.1 
 
 
184 aa  57.8  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3121  putative flavodoxin  36.79 
 
 
183 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197452  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1421  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
187 aa  57.4  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.9217  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3424  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.64 
 
 
184 aa  57.4  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4981  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.24 
 
 
185 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  42.16 
 
 
186 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3518  multimeric flavodoxin WrbA  41.49 
 
 
189 aa  55.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07059  oxidoreductase  38.53 
 
 
135 aa  55.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2573  putative flavodoxin  35.78 
 
 
184 aa  53.9  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.620204  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001005  multimeric flavodoxin WrbA  40.86 
 
 
194 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2929  putative flavodoxin  38.14 
 
 
193 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  41.76 
 
 
195 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1522  putative flavodoxin  32.38 
 
 
184 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4044  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.29 
 
 
204 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1044  tryptophan repressor binding protein  33.01 
 
 
178 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>