296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001005 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001005  multimeric flavodoxin WrbA  100 
 
 		 194 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07059  oxidoreductase  94.81 
 
 		 135 aa  266  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1421  NADPH-dependent FMN reductase  49.74 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.9217  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3518  multimeric flavodoxin WrbA  46.28 
 
 		 189 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03044  tryptophan repressor binding protein  40.7 
 
 		 191 aa  129  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3582  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.2 
 
 		 184 aa  129  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105689  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2207  putative TRP repressor binding protein  37.5 
 
 		 190 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.503271 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3424  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.6 
 
 		 184 aa  122  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2011  flavodoxin/nitric oxide synthase  38 
 
 		 190 aa  121  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2874  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.3 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00256934  hitchhiker  0.000000000000114365 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0295  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.21 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000113497 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2405  putative TRP repressor binding protein-like protein  38 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.570978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0234  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.21 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0242  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.21 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  hitchhiker  0.00000000952931 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0633  putative TRP repressor binding protein  40 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2791  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.69 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2449  tryptophan repressor binding protein  34.56 
 
 		 218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0315  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.69 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0022  flavodoxin domain-containing protein  37.37 
 
 		 264 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3414  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.63 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3113  flavodoxin domain-containing protein  38.38 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2589  flavodoxin domain-containing protein  37.37 
 
 		 191 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3529  multimeric flavodoxin WrbA  37.37 
 
 		 191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3127  flavodoxin domain-containing protein  37.37 
 
 		 191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3520  flavodoxin domain-containing protein  37.37 
 
 		 191 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1966  flavodoxin domain-containing protein  37.37 
 
 		 191 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.952042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3792  tryptophan repressor binding protein  37.37 
 
 		 191 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0417483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3854  tryptophan repressor binding protein  37.37 
 
 		 191 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2888  tryptophan repressor-binding protein  39.2 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.386778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2573  putative flavodoxin  36 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.620204  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3121  putative flavodoxin  38.66 
 
 		 183 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197452  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1180  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.18 
 
 		 183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2899  putative flavodoxin  37.37 
 
 		 184 aa  115  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4867  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.56 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392234  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0041  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.84 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0416  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.88 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.43833  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1090  NADPH-dependent FMN reductase  38.89 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.665175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0476  tryptophan repressor binding protein  38.38 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4944  hypothetical protein  37.06 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1522  putative flavodoxin  34.85 
 
 		 184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3284  NADPH-dependent FMN reductase  36.87 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.951999 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2929  putative flavodoxin  44.85 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2456  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.68 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6542  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.57 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381266 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3028  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.85 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2551  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.18 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5693  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.57 
 
 		 196 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3679  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.36 
 
 		 190 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0287676  hitchhiker  0.00000000000590116 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6057  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.57 
 
 		 196 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1709  NADPH-dependent FMN reductase  37.24 
 
 		 189 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0120762  normal  0.0625376 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2749  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.07 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4521  hypothetical protein  41.26 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0923053  normal  0.429536 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0278  flavoprotein  37.37 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000962932 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4063  hypothetical protein  41.26 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0979244  normal  0.350489 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1959  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.83 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4044  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.63 
 
 		 204 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1254  TRP repressor binding protein  33.68 
 
 		 200 aa  104  9e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.128964  normal  0.538833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4769  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.05 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5160  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.82 
 
 		 190 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.65126 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4981  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.84 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0554  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.86 
 
 		 184 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.519186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0487  multimeric flavodoxin  43.7 
 
 		 159 aa  101  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0456  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.15 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1129  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.98 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03195  hypothetical protein  35.26 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22540  putative flavodoxin  35.71 
 
 		 184 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000135401  hitchhiker  0.0000186487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1213  tryptophan repressor binding protein  43.48 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0487623 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  31.16 
 
 		 195 aa  95.9  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1570  NADPH-dependent FMN reductase  32.45 
 
 		 213 aa  94.7  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.101574  hitchhiker  0.00239279 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  32.66 
 
 		 186 aa  90.9  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002786  Trp repressor-binding protein  35.03 
 
 		 189 aa  90.9  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2990  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.95 
 
 		 198 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.991698  hitchhiker  0.0079617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1644  trp repressor binding protein  30 
 
 		 201 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4073  flavodoxin/nitric oxide synthase  30 
 
 		 201 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2521  Trp repressor-binding protein  30.65 
 
 		 205 aa  84.7  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  31.55 
 
 		 200 aa  84.7  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4229  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.32 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234243  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1246  flavoprotein WrbA  30 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000168945 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1044  tryptophan repressor binding protein  31.22 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1206  flavoprotein WrbA  29.5 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5355  flavoprotein WrbA  31.84 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272087  normal  0.149509 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1995  flavoprotein WrbA  31.4 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  30.58 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2247  flavoprotein WrbA  33.77 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.41 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.938759  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36830  WrbA-like flavodoxin  30.96 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.740574  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1665  flavoprotein WrbA  30.92 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204501  hitchhiker  0.00540913 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1686  trp repressor binding protein  30.1 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3703  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.36 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04556  tryptophan repressor binding protein  29.13 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.816043  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  30.1 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0274  hypothetical protein  31.44 
 
 		 168 aa  77.4  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.367825  normal  0.693938 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0705  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.89 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1474  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2340  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.08 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200739 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  30.1 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1050  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.68 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  30.2 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  30.2 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0737  flavoprotein WrbA  29.85 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.438501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>