282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0041 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0041  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 		 184 aa  375  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2456  flavodoxin/nitric oxide synthase  76.5 
 
 		 184 aa  294  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2551  flavodoxin/nitric oxide synthase  75.27 
 
 		 184 aa  294  6e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3028  flavodoxin/nitric oxide synthase  71.58 
 
 		 184 aa  272  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3582  flavodoxin/nitric oxide synthase  67.93 
 
 		 184 aa  267  7e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105689  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1180  flavodoxin/nitric oxide synthase  66.48 
 
 		 183 aa  259  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22540  putative flavodoxin  68.68 
 
 		 184 aa  256  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000135401  hitchhiker  0.0000186487 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3424  flavodoxin/nitric oxide synthase  66.85 
 
 		 184 aa  246  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3121  putative flavodoxin  62.78 
 
 		 183 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197452  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2573  putative flavodoxin  62.64 
 
 		 184 aa  241  5e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.620204  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2899  putative flavodoxin  63.39 
 
 		 184 aa  238  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0554  flavodoxin/nitric oxide synthase  68.85 
 
 		 184 aa  238  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.519186 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1522  putative flavodoxin  58.47 
 
 		 184 aa  233  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2888  tryptophan repressor-binding protein  60.44 
 
 		 184 aa  230  7.000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.386778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5160  flavodoxin/nitric oxide synthase  62.43 
 
 		 190 aa  228  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.65126 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4981  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.67 
 
 		 185 aa  226  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2929  putative flavodoxin  62.22 
 
 		 193 aa  223  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6542  flavodoxin/nitric oxide synthase  60 
 
 		 196 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381266 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03044  tryptophan repressor binding protein  57.98 
 
 		 191 aa  211  3.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4044  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.02 
 
 		 204 aa  210  9e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5693  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.44 
 
 		 196 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6057  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.44 
 
 		 196 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0456  flavodoxin/nitric oxide synthase  58.89 
 
 		 211 aa  207  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0242  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.85 
 
 		 190 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  hitchhiker  0.00000000952931 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3414  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.32 
 
 		 190 aa  205  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3113  flavodoxin domain-containing protein  57.45 
 
 		 237 aa  205  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2791  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.32 
 
 		 190 aa  204  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0315  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.32 
 
 		 190 aa  204  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4063  hypothetical protein  58.43 
 
 		 196 aa  204  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0979244  normal  0.350489 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0295  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.32 
 
 		 190 aa  204  8e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000113497 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4521  hypothetical protein  57.87 
 
 		 196 aa  203  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0923053  normal  0.429536 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0234  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.79 
 
 		 190 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0022  flavodoxin domain-containing protein  56.68 
 
 		 264 aa  201  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3854  tryptophan repressor binding protein  56.38 
 
 		 191 aa  200  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2589  flavodoxin domain-containing protein  56.38 
 
 		 191 aa  200  7e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3127  flavodoxin domain-containing protein  56.38 
 
 		 191 aa  201  7e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3529  multimeric flavodoxin WrbA  56.38 
 
 		 191 aa  201  7e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1966  flavodoxin domain-containing protein  56.38 
 
 		 191 aa  200  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.952042  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3520  flavodoxin domain-containing protein  56.38 
 
 		 191 aa  200  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3792  tryptophan repressor binding protein  56.38 
 
 		 191 aa  200  7e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0417483  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2207  putative TRP repressor binding protein  55.85 
 
 		 190 aa  199  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.503271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2449  tryptophan repressor binding protein  53.97 
 
 		 218 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2874  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.5 
 
 		 191 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00256934  hitchhiker  0.000000000000114365 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2405  putative TRP repressor binding protein-like protein  55.32 
 
 		 190 aa  195  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.570978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2011  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.32 
 
 		 190 aa  194  6e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3679  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.32 
 
 		 190 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0287676  hitchhiker  0.00000000000590116 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0278  flavoprotein  54.79 
 
 		 190 aa  182  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000962932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4944  hypothetical protein  50 
 
 		 203 aa  172  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  49.21 
 
 		 188 aa  167  5e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1090  NADPH-dependent FMN reductase  49.2 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.665175  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0633  putative TRP repressor binding protein  48.4 
 
 		 190 aa  162  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0476  tryptophan repressor binding protein  47.62 
 
 		 189 aa  159  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0416  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.62 
 
 		 189 aa  158  3e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.43833  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3284  NADPH-dependent FMN reductase  46.07 
 
 		 192 aa  158  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.951999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1959  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.32 
 
 		 189 aa  156  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4867  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.07 
 
 		 206 aa  152  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392234  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4769  flavodoxin/nitric oxide synthase  48.4 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1709  NADPH-dependent FMN reductase  46.11 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0120762  normal  0.0625376 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2749  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.32 
 
 		 184 aa  132  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1421  NADPH-dependent FMN reductase  40.41 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.9217  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0487  multimeric flavodoxin  50.72 
 
 		 159 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1254  TRP repressor binding protein  40.22 
 
 		 200 aa  123  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.128964  normal  0.538833 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1129  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.22 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1570  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.101574  hitchhiker  0.00239279 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1044  tryptophan repressor binding protein  40.88 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3518  multimeric flavodoxin WrbA  37.11 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  38.42 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001005  multimeric flavodoxin WrbA  33.84 
 
 		 194 aa  114  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07059  oxidoreductase  42.03 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  38.62 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1213  tryptophan repressor binding protein  42.47 
 
 		 205 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0487623 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  32.68 
 
 		 203 aa  85.1  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  31.07 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  30.05 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  30.81 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  29.91 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  29.47 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  31.86 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  31.16 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1333  hypothetical protein  42.86 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0541  hypothetical protein  42.86 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0614  hypothetical protein  42.86 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0804749  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  29.56 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  29.06 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  29.85 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  32.67 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  32.67 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  30.7 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  32.18 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  28.57 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  28.57 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  30.2 
 
 		 200 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1561  tryptophan repressor binding protein  41.35 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.789174  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0896  flavoprotein WrbA  26.11 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  27.09 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  26.7 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5355  flavoprotein WrbA  29.95 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272087  normal  0.149509 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  28.71 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0428  NADPH-dependent FMN reductase  28.5 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  26.6 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>