293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0896 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0896  flavoprotein WrbA  100 
 
 		 197 aa  407  1e-113  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0428  NADPH-dependent FMN reductase  72.08 
 
 		 197 aa  310  7.999999999999999e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  44.44 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  42.93 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  43.28 
 
 		 203 aa  155  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0408  trp repressor binding protein  42.21 
 
 		 197 aa  155  4e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1766  NAD(P)H:quinone oxidoreductase, type IV  42.21 
 
 		 197 aa  155  4e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  42.93 
 
 		 200 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1050  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.64 
 
 		 202 aa  153  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  42.42 
 
 		 200 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  43 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  45.77 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  42.93 
 
 		 200 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  40.91 
 
 		 200 aa  152  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  43.43 
 
 		 200 aa  152  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  40.61 
 
 		 199 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  41.92 
 
 		 200 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  40.61 
 
 		 199 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  42.42 
 
 		 200 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1206  flavoprotein WrbA  40.98 
 
 		 201 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1246  flavoprotein WrbA  40.98 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000168945 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  46.04 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5355  flavoprotein WrbA  43.43 
 
 		 199 aa  149  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272087  normal  0.149509 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3216  flavoprotein WrbA  41.92 
 
 		 199 aa  149  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103808 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2247  flavoprotein WrbA  40 
 
 		 205 aa  148  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  41.41 
 
 		 200 aa  148  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  42.42 
 
 		 199 aa  148  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0558  flavoprotein WrbA  43.59 
 
 		 205 aa  148  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.731292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1644  trp repressor binding protein  40.49 
 
 		 201 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4073  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.49 
 
 		 201 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  41.29 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4229  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.49 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234243  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03195  hypothetical protein  39.09 
 
 		 190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  39.09 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4560  Trp repressor binding protein WrbA  40.98 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.309608  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1823  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.35 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002786  Trp repressor-binding protein  38.27 
 
 		 189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51990  Trp repressor binding protein WrbA  40.98 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164992 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04556  tryptophan repressor binding protein  39.49 
 
 		 218 aa  145  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.816043  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1979  tryptophan repressor binding protein  40.82 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  41.41 
 
 		 200 aa  145  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2043  TrpR binding protein WrbA  43.22 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0806093  normal  0.0679166 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.11 
 
 		 200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.938759  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  43.65 
 
 		 201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2261  TrpR binding protein WrbA  43.22 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.999788  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2363  TrpR binding protein WrbA  43.22 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00380027  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  39.09 
 
 		 200 aa  145  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2990  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.7 
 
 		 198 aa  145  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.991698  hitchhiker  0.0079617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  42.42 
 
 		 199 aa  144  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  38.89 
 
 		 200 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0899  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  41.5 
 
 		 199 aa  144  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000786086 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  38.89 
 
 		 200 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2521  Trp repressor-binding protein  40.51 
 
 		 205 aa  143  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0715  flavoprotein WrbA  38.46 
 
 		 197 aa  143  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.358899 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0373  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.57 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267004  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0142  flavoprotein WrbA  39.9 
 
 		 209 aa  143  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2340  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.5 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200739 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  40.5 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1686  trp repressor binding protein  38.69 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1516  TrpR binding protein WrbA  41.71 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.348571 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1813  TrpR binding protein WrbA  42.5 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000250234  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3703  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.13 
 
 		 201 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1183  TrpR binding protein WrbA  42.93 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1214  TrpR binding protein WrbA  42.93 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.332262 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1078  TrpR binding protein WrbA  42.93 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1229  TrpR binding protein WrbA  42.93 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.570385 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1194  TrpR binding protein WrbA  42.93 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0439  tryptophan repressor binding protein  38.14 
 
 		 199 aa  141  6e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5986  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):flavodoxin/nitric oxide synthase  38.73 
 
 		 208 aa  141  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02144  Flavodoxin/nitric oxide synthase  39.09 
 
 		 200 aa  141  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0314978  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0384  flavoprotein WrbA  38.14 
 
 		 199 aa  141  8e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2181  TrpR binding protein WrbA  37.69 
 
 		 199 aa  140  9e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01007  TrpR binding protein WrbA  41.41 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2638  flavoprotein WrbA  41.41 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.836437  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1122  TrpR binding protein WrbA  41.41 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98388  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01014  hypothetical protein  41.41 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2591  TrpR binding protein WrbA  41.41 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.172537 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1117  TrpR binding protein WrbA  41.41 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0737  flavoprotein WrbA  40.1 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.438501  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2120  TrpR binding protein WrbA  41.41 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  42.29 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36830  WrbA-like flavodoxin  39.38 
 
 		 200 aa  139  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.740574  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0057  flavoprotein WrbA  38.58 
 
 		 200 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3618  flavoprotein WrbA  42.36 
 
 		 205 aa  138  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1014  TrpR binding protein WrbA  40.1 
 
 		 199 aa  138  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1353  putative Trp repressor binding protein  40.51 
 
 		 200 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.873787  normal  0.272914 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1897  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.19 
 
 		 209 aa  138  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0700  hypothetical protein  38.05 
 
 		 199 aa  137  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  39 
 
 		 204 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5419  flavoprotein WrbA  36.06 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0979  TrpR binding protein WrbA  39.09 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  39.8 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1746  Trp repressor-binding protein  38.34 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1130  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.66 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0057993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1242  TrpR binding protein WrbA  40.91 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4506  TrpR binding protein WrbA  39.39 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860905  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2002  TrpR binding protein WrbA  43.65 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1455  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.74 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0705  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.78 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1474  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4564  TrpR binding protein WrbA  39.9 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>