273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_1014 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_1014  TrpR binding protein WrbA  100 
 
 
199 aa  407  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1049  TrpR binding protein WrbA  98.99 
 
 
199 aa  402  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2136  TrpR binding protein WrbA  92.42 
 
 
199 aa  377  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1341  TrpR binding protein WrbA  75.63 
 
 
199 aa  285  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.357847  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  70.35 
 
 
199 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  70.35 
 
 
199 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  69.35 
 
 
199 aa  277  7e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  68.02 
 
 
200 aa  276  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  66.33 
 
 
199 aa  270  8.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4352  TrpR binding protein WrbA  66.33 
 
 
199 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  66.83 
 
 
199 aa  269  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  64.97 
 
 
200 aa  267  8.999999999999999e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2810  TrpR binding protein WrbA  66.33 
 
 
199 aa  266  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.111031 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0979  TrpR binding protein WrbA  64.82 
 
 
199 aa  264  8e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4506  TrpR binding protein WrbA  63.82 
 
 
199 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860905  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1650  TrpR binding protein WrbA  64.82 
 
 
199 aa  259  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207552  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1594  TrpR binding protein WrbA  61.93 
 
 
198 aa  255  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  62.81 
 
 
212 aa  255  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0784  TrpR binding protein WrbA  63.32 
 
 
199 aa  255  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0978  TrpR binding protein WrbA  62.81 
 
 
199 aa  254  8e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.642178  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3216  flavoprotein WrbA  61.81 
 
 
199 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103808 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4564  TrpR binding protein WrbA  64.82 
 
 
208 aa  252  3e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1023  flavoprotein WrbA  66.83 
 
 
199 aa  251  4.0000000000000004e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0057  flavoprotein WrbA  61.81 
 
 
200 aa  251  5.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4332  flavoprotein WrbA  62.81 
 
 
199 aa  245  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2181  TrpR binding protein WrbA  60.91 
 
 
199 aa  241  5e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1683  flavoprotein WrbA  64.92 
 
 
207 aa  240  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.308348  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  60.1 
 
 
200 aa  240  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3669  TrpR binding protein WrbA  59.8 
 
 
199 aa  239  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.196893 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  61.66 
 
 
206 aa  238  4e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  59.6 
 
 
200 aa  236  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  59.09 
 
 
200 aa  235  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  59.39 
 
 
201 aa  234  4e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  59.09 
 
 
200 aa  234  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2002  TrpR binding protein WrbA  64.32 
 
 
199 aa  234  5.0000000000000005e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  59.09 
 
 
200 aa  234  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5226  TrpR binding protein WrbA  61.05 
 
 
203 aa  233  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1813  TrpR binding protein WrbA  61.62 
 
 
199 aa  231  6e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000250234  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  58.59 
 
 
200 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  58.08 
 
 
200 aa  229  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2363  TrpR binding protein WrbA  59.5 
 
 
199 aa  229  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00380027  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2261  TrpR binding protein WrbA  59.5 
 
 
199 aa  229  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.999788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2043  TrpR binding protein WrbA  59.5 
 
 
199 aa  229  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0806093  normal  0.0679166 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  58.08 
 
 
200 aa  228  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  57.5 
 
 
200 aa  228  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4096  TrpR binding protein WrbA  57.29 
 
 
199 aa  228  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.832118  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  57 
 
 
200 aa  226  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  57 
 
 
200 aa  226  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  55.56 
 
 
200 aa  225  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  58 
 
 
199 aa  224  6e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8249  flavoprotein WrbA  57.79 
 
 
199 aa  224  9e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.907663  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1078  TrpR binding protein WrbA  59 
 
 
198 aa  222  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1183  TrpR binding protein WrbA  59 
 
 
198 aa  222  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165059  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1229  TrpR binding protein WrbA  59 
 
 
198 aa  222  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.570385 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1194  TrpR binding protein WrbA  59 
 
 
198 aa  222  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0608  TrpR binding protein WrbA  59.5 
 
 
198 aa  222  3e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1214  TrpR binding protein WrbA  59 
 
 
198 aa  222  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.332262 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4089  flavoprotein WrbA  58.5 
 
 
199 aa  221  4e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3134  TrpR binding protein WrbA  57.71 
 
 
199 aa  218  3.9999999999999997e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01007  TrpR binding protein WrbA  58 
 
 
198 aa  218  7e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2638  flavoprotein WrbA  58 
 
 
198 aa  218  7e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.836437  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01014  hypothetical protein  58 
 
 
198 aa  218  7e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1122  TrpR binding protein WrbA  58 
 
 
198 aa  218  7e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98388  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2591  TrpR binding protein WrbA  58 
 
 
198 aa  218  7e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.172537 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1117  TrpR binding protein WrbA  58 
 
 
198 aa  218  7e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2120  TrpR binding protein WrbA  58 
 
 
198 aa  218  7e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1932  TrpR binding protein WrbA  59.6 
 
 
199 aa  217  8.999999999999998e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.66734  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  56.22 
 
 
201 aa  214  7e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1242  TrpR binding protein WrbA  57 
 
 
198 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1516  TrpR binding protein WrbA  57.5 
 
 
198 aa  209  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.348571 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4139  flavoprotein WrbA  55.33 
 
 
198 aa  209  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000384114  unclonable  0.00000000000397831 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0396  flavoprotein WrbA  56.63 
 
 
212 aa  206  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  51.98 
 
 
203 aa  204  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0373  flavodoxin/nitric oxide synthase  53.27 
 
 
202 aa  201  6e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267004  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00380  TrpR binding protein WrbA  55.5 
 
 
198 aa  200  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2222  flavoprotein WrbA  55.33 
 
 
203 aa  198  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  51.49 
 
 
204 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  49.75 
 
 
203 aa  193  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  49.75 
 
 
203 aa  190  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  45.1 
 
 
204 aa  180  9.000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  47.26 
 
 
204 aa  180  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  48.54 
 
 
204 aa  179  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3178  flavoprotein WrbA  48.76 
 
 
204 aa  177  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2234  flavoprotein WrbA  47.76 
 
 
206 aa  176  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1914  TrpR binding protein WrbA  45.19 
 
 
208 aa  166  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.936643 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04350  cytoplasm protein, putative  41.71 
 
 
340 aa  150  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.4788  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5355  flavoprotein WrbA  42.65 
 
 
199 aa  148  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272087  normal  0.149509 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79909  predicted protein  41.29 
 
 
277 aa  147  9e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.147925 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85539  predicted protein  40.1 
 
 
200 aa  145  3e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.08977 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0768  flavoprotein WrbA  42.71 
 
 
208 aa  141  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04240  cytoplasm protein, putative  38.58 
 
 
211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.538448  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00297  NADH-quinone oxidoreductase Pst2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02820)  36.68 
 
 
204 aa  138  4.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0359141  normal  0.396271 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0896  flavoprotein WrbA  40.1 
 
 
197 aa  138  4.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31495  predicted protein  38.46 
 
 
201 aa  137  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0157173  normal  0.0627326 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44845  predicted protein  36.41 
 
 
202 aa  136  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.357205  normal  0.0582237 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5419  flavoprotein WrbA  41.18 
 
 
209 aa  135  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5986  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):flavodoxin/nitric oxide synthase  42.23 
 
 
208 aa  135  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1251  flavoprotein WrbA  41.62 
 
 
206 aa  135  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0142  flavoprotein WrbA  40.61 
 
 
209 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1050  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.71 
 
 
202 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>