276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0142 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0142  flavoprotein WrbA  100 
 
 
209 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3618  flavoprotein WrbA  69.46 
 
 
205 aa  303  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700273  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5355  flavoprotein WrbA  60 
 
 
199 aa  250  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272087  normal  0.149509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3183  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.43 
 
 
205 aa  231  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.202353  decreased coverage  0.0000326844 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1973  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.95 
 
 
205 aa  229  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425402  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0636  flavodoxin/nitric oxide synthase  52.02 
 
 
210 aa  222  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1050  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.73 
 
 
202 aa  220  9e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2478  flavoprotein WrbA  58.85 
 
 
205 aa  211  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1251  flavoprotein WrbA  51.72 
 
 
206 aa  205  5e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4633  hypothetical protein  53.65 
 
 
226 aa  204  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0518  flavoprotein WrbA  55 
 
 
204 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0188609  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2335  trp repressor binding protein WrbA, putative  50.26 
 
 
197 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.634232  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1010  flavodoxin/nitric oxide synthase  49.74 
 
 
197 aa  188  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1591  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.46 
 
 
197 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.741736  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1341  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.21 
 
 
201 aa  174  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.519594  normal  0.441102 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5419  flavoprotein WrbA  43.78 
 
 
209 aa  162  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0768  flavoprotein WrbA  44.68 
 
 
208 aa  161  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  44.06 
 
 
204 aa  160  9e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5986  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):flavodoxin/nitric oxide synthase  43.65 
 
 
208 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1878  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.47 
 
 
202 aa  160  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2126  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.67 
 
 
198 aa  158  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2806  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.55 
 
 
204 aa  154  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.54892  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  43.28 
 
 
204 aa  153  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  40.89 
 
 
200 aa  143  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0896  flavoprotein WrbA  39.9 
 
 
197 aa  143  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2136  TrpR binding protein WrbA  41.62 
 
 
199 aa  140  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  39.51 
 
 
203 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  41.5 
 
 
203 aa  135  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1014  TrpR binding protein WrbA  40.61 
 
 
199 aa  134  8e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  38.73 
 
 
203 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1049  TrpR binding protein WrbA  40.1 
 
 
199 aa  132  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  38.58 
 
 
199 aa  132  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  38.58 
 
 
199 aa  132  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0428  NADPH-dependent FMN reductase  38.38 
 
 
197 aa  131  6.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3216  flavoprotein WrbA  36.82 
 
 
199 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0979  TrpR binding protein WrbA  37.06 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1594  TrpR binding protein WrbA  38.58 
 
 
198 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  38.16 
 
 
212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  37.56 
 
 
199 aa  128  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  35.78 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  36.55 
 
 
199 aa  126  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  36.14 
 
 
200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  35.53 
 
 
199 aa  125  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4564  TrpR binding protein WrbA  38.42 
 
 
208 aa  125  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0396  flavoprotein WrbA  39.22 
 
 
212 aa  123  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4352  TrpR binding protein WrbA  35.53 
 
 
199 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4506  TrpR binding protein WrbA  35.53 
 
 
199 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860905  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2234  flavoprotein WrbA  36 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  35.47 
 
 
200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  35.47 
 
 
200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1650  TrpR binding protein WrbA  35 
 
 
199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207552  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  35.18 
 
 
201 aa  118  7e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  36.82 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  36.59 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0784  TrpR binding protein WrbA  33.67 
 
 
199 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3178  flavoprotein WrbA  36.59 
 
 
204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  34.83 
 
 
200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  35.35 
 
 
200 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0057  flavoprotein WrbA  34.48 
 
 
200 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  35.35 
 
 
200 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0978  TrpR binding protein WrbA  34.52 
 
 
199 aa  114  8.999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.642178  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1914  TrpR binding protein WrbA  36.54 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.936643 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  35.35 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  34.52 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2810  TrpR binding protein WrbA  34.69 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.111031 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  34.34 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  35.68 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0373  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.62 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267004  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  34.33 
 
 
200 aa  112  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1683  flavoprotein WrbA  36.59 
 
 
207 aa  112  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.308348  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  33.83 
 
 
200 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  33.83 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  33.33 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1194  TrpR binding protein WrbA  36.36 
 
 
198 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1078  TrpR binding protein WrbA  36.36 
 
 
198 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1183  TrpR binding protein WrbA  36.36 
 
 
198 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165059  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1214  TrpR binding protein WrbA  36.36 
 
 
198 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.332262 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1206  flavoprotein WrbA  33.8 
 
 
201 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1229  TrpR binding protein WrbA  36.36 
 
 
198 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.570385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1246  flavoprotein WrbA  33.66 
 
 
201 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000168945 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01007  TrpR binding protein WrbA  36.36 
 
 
198 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2638  flavoprotein WrbA  36.36 
 
 
198 aa  108  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.836437  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1644  trp repressor binding protein  34.27 
 
 
201 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4073  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.27 
 
 
201 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2591  TrpR binding protein WrbA  36.36 
 
 
198 aa  108  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.172537 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1122  TrpR binding protein WrbA  36.36 
 
 
198 aa  108  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98388  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2120  TrpR binding protein WrbA  36.36 
 
 
198 aa  108  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01014  hypothetical protein  36.36 
 
 
198 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1117  TrpR binding protein WrbA  36.36 
 
 
198 aa  108  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  31.34 
 
 
199 aa  108  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04350  cytoplasm protein, putative  34.8 
 
 
340 aa  107  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.4788  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4096  TrpR binding protein WrbA  36.13 
 
 
199 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.832118  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1341  TrpR binding protein WrbA  36.14 
 
 
199 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.357847  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1242  TrpR binding protein WrbA  35.86 
 
 
198 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2002  TrpR binding protein WrbA  37.06 
 
 
199 aa  106  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36830  WrbA-like flavodoxin  36.36 
 
 
200 aa  105  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.740574  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04240  cytoplasm protein, putative  32.55 
 
 
211 aa  105  7e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.538448  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1023  flavoprotein WrbA  34.52 
 
 
199 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1813  TrpR binding protein WrbA  35.15 
 
 
199 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000250234  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2181  TrpR binding protein WrbA  32.99 
 
 
199 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>