278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1341 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1341  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 		 201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.519594  normal  0.441102 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0636  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.5 
 
 		 210 aa  258  5.0000000000000005e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2126  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.54 
 
 		 198 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2478  flavoprotein WrbA  51.79 
 
 		 205 aa  189  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0142  flavoprotein WrbA  47.21 
 
 		 209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1973  flavodoxin/nitric oxide synthase  49.43 
 
 		 205 aa  175  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3618  flavoprotein WrbA  48 
 
 		 205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3183  flavodoxin/nitric oxide synthase  48 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.202353  decreased coverage  0.0000326844 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1251  flavoprotein WrbA  44.78 
 
 		 206 aa  169  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1050  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.62 
 
 		 202 aa  169  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1591  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.22 
 
 		 197 aa  160  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.741736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5355  flavoprotein WrbA  44.67 
 
 		 199 aa  158  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272087  normal  0.149509 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0518  flavoprotein WrbA  46.83 
 
 		 204 aa  154  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0188609  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1010  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.27 
 
 		 197 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2335  trp repressor binding protein WrbA, putative  44.78 
 
 		 197 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.634232  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4633  hypothetical protein  49.44 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1878  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.1 
 
 		 202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5419  flavoprotein WrbA  40.67 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5986  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):flavodoxin/nitric oxide synthase  40.59 
 
 		 208 aa  134  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2806  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.5 
 
 		 204 aa  131  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.54892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0768  flavoprotein WrbA  40.11 
 
 		 208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  38.92 
 
 		 199 aa  121  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  38.92 
 
 		 199 aa  121  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  38.92 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0896  flavoprotein WrbA  36.27 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04556  tryptophan repressor binding protein  37.19 
 
 		 218 aa  117  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.816043  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.18 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.938759  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  38.81 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  35.47 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  35.47 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  37.14 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  38.31 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1766  NAD(P)H:quinone oxidoreductase, type IV  36.18 
 
 		 197 aa  111  6e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2247  flavoprotein WrbA  35.68 
 
 		 205 aa  111  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0408  trp repressor binding protein  36.18 
 
 		 197 aa  111  6e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0700  hypothetical protein  35.78 
 
 		 199 aa  111  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3178  flavoprotein WrbA  39.02 
 
 		 204 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  35.92 
 
 		 203 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0715  flavoprotein WrbA  36.5 
 
 		 197 aa  111  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.358899 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0682  hypothetical protein  35.78 
 
 		 199 aa  111  9e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  34.76 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  36.71 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  36.63 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  39.89 
 
 		 203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  34.98 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0428  NADPH-dependent FMN reductase  35.47 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1242  TrpR binding protein WrbA  35.61 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  37.13 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0979  TrpR binding protein WrbA  34.98 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2779  flavoprotein WrbA  34.83 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01007  TrpR binding protein WrbA  35.61 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2638  flavoprotein WrbA  35.61 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.836437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1117  TrpR binding protein WrbA  35.61 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01014  hypothetical protein  35.61 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0439  tryptophan repressor binding protein  35.47 
 
 		 199 aa  108  6e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  36.05 
 
 		 200 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2120  TrpR binding protein WrbA  35.61 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3216  flavoprotein WrbA  36.45 
 
 		 199 aa  108  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103808 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1122  TrpR binding protein WrbA  35.61 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98388  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2591  TrpR binding protein WrbA  35.61 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.172537 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  34.76 
 
 		 204 aa  108  6e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02144  Flavodoxin/nitric oxide synthase  33.84 
 
 		 200 aa  108  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0314978  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0384  flavoprotein WrbA  35.47 
 
 		 199 aa  108  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  36.05 
 
 		 200 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0784  TrpR binding protein WrbA  37.57 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  35.26 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  35.84 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0373  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.58 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267004  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4096  TrpR binding protein WrbA  33.99 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.832118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1979  tryptophan repressor binding protein  37 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2002  TrpR binding protein WrbA  38.65 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  35.26 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4560  Trp repressor binding protein WrbA  35.15 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.309608  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  38.46 
 
 		 200 aa  105  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  34.31 
 
 		 199 aa  105  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2485  flavodoxin/nitric oxide synthase  35 
 
 		 198 aa  104  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51990  Trp repressor binding protein WrbA  34.65 
 
 		 198 aa  104  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164992 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1813  TrpR binding protein WrbA  36.95 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000250234  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  34.68 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1214  TrpR binding protein WrbA  34.63 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.332262 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1183  TrpR binding protein WrbA  34.63 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1078  TrpR binding protein WrbA  34.63 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2990  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.99 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.991698  hitchhiker  0.0079617 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0978  TrpR binding protein WrbA  36.41 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.642178  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1194  TrpR binding protein WrbA  34.63 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4506  TrpR binding protein WrbA  37.57 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860905  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4332  flavoprotein WrbA  34.15 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1229  TrpR binding protein WrbA  34.63 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.570385 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1665  flavoprotein WrbA  36.45 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204501  hitchhiker  0.00540913 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4229  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.15 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234243  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1206  flavoprotein WrbA  34.48 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4352  TrpR binding protein WrbA  38.73 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3669  TrpR binding protein WrbA  34.47 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196893 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1995  flavoprotein WrbA  36.45 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3134  TrpR binding protein WrbA  35.12 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1650  TrpR binding protein WrbA  37.99 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1823  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.33 
 
 		 199 aa  101  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0520  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.58 
 
 		 184 aa  101  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3069  flavodoxin-like protein  37.3 
 
 		 198 aa  101  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.432129  hitchhiker  0.00072414 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1249  NADPH-dependent FMN reductase:flavodoxin/nitric oxide synthase  34.63 
 
 		 200 aa  101  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>