278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3618 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3618  flavoprotein WrbA  100 
 
 		 205 aa  421  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0142  flavoprotein WrbA  69.46 
 
 		 209 aa  317  6e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3183  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.39 
 
 		 205 aa  246  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.202353  decreased coverage  0.0000326844 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1973  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.9 
 
 		 205 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5355  flavoprotein WrbA  57.95 
 
 		 199 aa  241  7e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272087  normal  0.149509 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1050  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.29 
 
 		 202 aa  229  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2478  flavoprotein WrbA  61.46 
 
 		 205 aa  219  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0636  flavodoxin/nitric oxide synthase  51.76 
 
 		 210 aa  214  5.9999999999999996e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4633  hypothetical protein  52.76 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0518  flavoprotein WrbA  53 
 
 		 204 aa  189  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0188609  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1251  flavoprotein WrbA  45.27 
 
 		 206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5986  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):flavodoxin/nitric oxide synthase  47.03 
 
 		 208 aa  178  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0768  flavoprotein WrbA  49.21 
 
 		 208 aa  178  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2335  trp repressor binding protein WrbA, putative  46.19 
 
 		 197 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.634232  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5419  flavoprotein WrbA  46.27 
 
 		 209 aa  177  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1010  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.69 
 
 		 197 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1591  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.95 
 
 		 197 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.741736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1341  flavodoxin/nitric oxide synthase  48 
 
 		 201 aa  170  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.519594  normal  0.441102 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2806  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.37 
 
 		 204 aa  164  9e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.54892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1878  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.73 
 
 		 202 aa  162  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2126  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.19 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  45.27 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  44.5 
 
 		 199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  44.5 
 
 		 199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  42.79 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  44.12 
 
 		 200 aa  148  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  44.5 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0896  flavoprotein WrbA  42.36 
 
 		 197 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  42.5 
 
 		 199 aa  144  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  41.46 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  42.36 
 
 		 200 aa  142  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  41.5 
 
 		 199 aa  142  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4564  TrpR binding protein WrbA  41.26 
 
 		 208 aa  141  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  44.33 
 
 		 203 aa  141  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3216  flavoprotein WrbA  41.29 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103808 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  42.16 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1594  TrpR binding protein WrbA  41.5 
 
 		 198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  41.38 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  41.63 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1014  TrpR binding protein WrbA  40.3 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2136  TrpR binding protein WrbA  40.39 
 
 		 199 aa  135  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1049  TrpR binding protein WrbA  39.8 
 
 		 199 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  40.69 
 
 		 201 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0428  NADPH-dependent FMN reductase  40.89 
 
 		 197 aa  134  8e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  40.5 
 
 		 200 aa  131  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  40.5 
 
 		 200 aa  131  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3178  flavoprotein WrbA  42.65 
 
 		 204 aa  131  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0979  TrpR binding protein WrbA  39.7 
 
 		 199 aa  131  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0978  TrpR binding protein WrbA  40.2 
 
 		 199 aa  129  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.642178  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  39.3 
 
 		 199 aa  129  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1650  TrpR binding protein WrbA  39.11 
 
 		 199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0373  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.1 
 
 		 202 aa  128  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267004  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2234  flavoprotein WrbA  41.38 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  38.19 
 
 		 201 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1813  TrpR binding protein WrbA  40 
 
 		 199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000250234  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  38.31 
 
 		 200 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  40.1 
 
 		 200 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0396  flavoprotein WrbA  40.49 
 
 		 212 aa  123  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0057  flavoprotein WrbA  39.13 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  41.58 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4506  TrpR binding protein WrbA  38.69 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860905  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4352  TrpR binding protein WrbA  38.69 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  37.81 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3134  TrpR binding protein WrbA  41.18 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0784  TrpR binding protein WrbA  39.2 
 
 		 199 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1914  TrpR binding protein WrbA  39.9 
 
 		 208 aa  122  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.936643 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  37.37 
 
 		 200 aa  121  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1194  TrpR binding protein WrbA  39.41 
 
 		 198 aa  121  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1183  TrpR binding protein WrbA  39.41 
 
 		 198 aa  121  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1229  TrpR binding protein WrbA  39.41 
 
 		 198 aa  121  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.570385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1214  TrpR binding protein WrbA  39.41 
 
 		 198 aa  121  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.332262 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1078  TrpR binding protein WrbA  39.41 
 
 		 198 aa  121  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2810  TrpR binding protein WrbA  36.5 
 
 		 199 aa  121  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111031 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  37.07 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  38.12 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  37.62 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  38.61 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  38.12 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2363  TrpR binding protein WrbA  40.1 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00380027  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2261  TrpR binding protein WrbA  40.1 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.999788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2043  TrpR binding protein WrbA  40.1 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0806093  normal  0.0679166 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1683  flavoprotein WrbA  37.32 
 
 		 207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.308348  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  38.12 
 
 		 200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1023  flavoprotein WrbA  40.2 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2181  TrpR binding protein WrbA  36.5 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4332  flavoprotein WrbA  37 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  36.82 
 
 		 200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4139  flavoprotein WrbA  40 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000384114  unclonable  0.00000000000397831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4096  TrpR binding protein WrbA  38 
 
 		 199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.832118  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01007  TrpR binding protein WrbA  38.42 
 
 		 198 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2638  flavoprotein WrbA  38.42 
 
 		 198 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.836437  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01014  hypothetical protein  38.42 
 
 		 198 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2591  TrpR binding protein WrbA  38.42 
 
 		 198 aa  116  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.172537 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1117  TrpR binding protein WrbA  38.42 
 
 		 198 aa  116  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1122  TrpR binding protein WrbA  38.42 
 
 		 198 aa  116  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98388  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0558  flavoprotein WrbA  41.71 
 
 		 205 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.731292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2120  TrpR binding protein WrbA  38.42 
 
 		 198 aa  116  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3669  TrpR binding protein WrbA  35.5 
 
 		 199 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196893 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2002  TrpR binding protein WrbA  39 
 
 		 199 aa  115  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1516  TrpR binding protein WrbA  38.81 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.348571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>